EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44751 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:13330021-13331049 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr5:13330460-13330471GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr5:13330460-13330471GTTTTATTGCC-6.62
HOXD9MA0913.2chr5:13330460-13330470GTTTTATTGC-6.02
PRDM1MA0508.2chr5:13330168-13330178GTGAAAGTGA-6.02
Enhancer Sequence
AGGCTGAAAG ACATGAACAT GTGTCTGTTA GTTATTGATC TGTCTGAAAC AGAGCTTTCC 60
TGACCGGATG AGGCTTTTCT GTCCCACTGA GAGGTCTTAA TGCTTGTAGG AAGTGGGGAG 120
AGAAGTATAT GAGGGAGACG TATAATGGTG AAAGTGAAGC TGGATTGATT TTAGATGAAT 180
CTTATAATTG AGTTAATGTG TGGTATATTC TCTCCTGCAT GATAATGCAC TGAGAACCCA 240
ATGACCCAAT GAAAAAGTGC ATGCGTGCGT GTGAATGTGT GTCACAATGA AGTGAAAGGT 300
AATGTATTTT CTGGATATTT ACAGGAATCA GAGAGTGAAA TTCAATACAT TTTAATACGT 360
TTTTTAAAGA CCCTTTCCAT AGATTTCAAG ACCGCATGAC CACTTTAGCT TTTAAACAGT 420
AATATCAGAA TCTGAAAGAG TTTTATTGCC CGGTATGTTC ACACATACGA GGAATTTGTT 480
ATCGTGACAG AGCTTCTGCA GTGCAACAGA ATGACAGAGA TAGGACAAAA ACAGATCATA 540
ATAAATATAA CAACAAGAAT CAGTCCAAGG CACTCGAGAA ATGTGAAAAA TTTAAAAAGC 600
CTTTATTCAC ATGGCTTAAT CTCTAAAAAC CTACGCGTTT CGGCAAGAGT CTGCCTTCAT 660
CAGGGTAACA GTGATCAGGT GCGTCTAGAT TCTCTTTTAA GTACTACGGT CACATGACTC 720
GTTTAAACAT CTCAAATGGC ACTCAAATAA TTTAACAAAC AAAGTCTACT ATCATAAATT 780
CGGCATAGAT ACATAAACAC CCACTTGCAT ATGGGAAAAG AGAGAGAGAA GAAGAAGAAA 840
AAAAGGGAAA ATACACATAC ATGTATATAT ATATATATAT ATATATATGT GTGTATATAT 900
ATATATATAT ATATATATAT ACACACAGAG ACTCTAGATA TATAAAGAGA GTCTAGACGC 960
ACCTGATCAC TGTTACCCTG ATGAAGGCAG ACTCTTGCCG AAACGCGTAG GTTTTTAGAG 1020
ATTTAGCC 1028