EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44576 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:6605772-6607453 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr5:6606206-6606225TAGCGCCACCTGCTGACAG-6.51
CTCFMA0139.1chr5:6605809-6605828TTGCGCCACCTGCTGGCAG-7.51
CTCFMA0139.1chr5:6605942-6605961CAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.03
CTCFMA0139.1chr5:6606073-6606092TAGCGCCATCTGGTGGCAG-8.3
CTCFMA0139.1chr5:6607106-6607125TAGCGCCACCTGCTGGCCA-9.81
GSX1MA0892.1chr5:6606371-6606381TTTAATTAGG-6.02
IKZF1MA1508.1chr5:6607298-6607310GGAACAGGAAGT+6.44
IKZF1MA1508.1chr5:6606991-6607003AAAACAGGAAGT+6.74
KLF13MA0657.1chr5:6607399-6607417TTGAAGTGGGCGTGGCAA-6.21
KLF13MA0657.1chr5:6606612-6606630CGGAAGTGGGCGTGGCAA-6.46
KLF14MA0740.1chr5:6607251-6607265AGAGGGGCGTGTCC-6.17
KLF14MA0740.1chr5:6606615-6606629AAGTGGGCGTGGCA-7.73
KLF14MA0740.1chr5:6607402-6607416AAGTGGGCGTGGCA-7.73
SP1MA0079.4chr5:6606616-6606631AGTGGGCGTGGCAAA-6.18
SP1MA0079.4chr5:6607403-6607418AGTGGGCGTGGCAAA-6.18
SP3MA0746.2chr5:6606616-6606629AGTGGGCGTGGCA-6.71
SP3MA0746.2chr5:6607403-6607416AGTGGGCGTGGCA-6.71
SP4MA0685.1chr5:6606614-6606631GAAGTGGGCGTGGCAAA-6.99
SP4MA0685.1chr5:6607401-6607418GAAGTGGGCGTGGCAAA-6.99
SP8MA0747.1chr5:6606616-6606628AGTGGGCGTGGC-7.22
SP8MA0747.1chr5:6607403-6607415AGTGGGCGTGGC-7.22
SPICMA0687.1chr5:6606990-6607004CAAAACAGGAAGTC+6.22
Enhancer Sequence
TCCTGAACAC ATCCACATAA CAATATTGAG TCAGTCATTG CGCCACCTGC TGGCAGAAGG 60
TAGTTTGGCT TATATTTCAG CCACACAATG TCTGATTTGC CTGAAACTTC ACATGGTTGA 120
TTAAATTCCA TTACTAAAGG CATCTACATG CCAATCTTAA GTCACAGTTA CAGCGCCACC 180
TGCTGGCAGA TGGTAGTTTG CATTATAACT CAACCACACA AAGTCCGATC TGCCTGAAAC 240
TTCACATGGT TAATAAAAGT CCTCTCCTGA ACACATCTAC ATAACAATAA TAAGTCTGGC 300
ATAGCGCCAT CTGGTGGCAG AAGGAAGTTT GCCTTATAAC TCAGCCACAC AATGTCTGAC 360
CTGCCTGAAA ACTCACATGG TTGATAAGAT TCCTCTCCTG AAGACATCTA CATGCCAATC 420
TTAAGTCACA GTTATAGCGC CACCTGCTGA CAGGAGGAAG TTTGGCATAA ATCTGTGATT 480
TTCCCAGGTT CTTTATTTAT ATTGGCTTAA ATTATTATTG TTCACTCTTC TCTGTCATCT 540
TGAGGCCACT GGGCGGCGGT GAGCCCGGGT GCGAGGTCCC TATCATCGCT GCTTGCAGCT 600
TTAATTAGGG ACCGAGCACC GAACGGTGCA AGGCCCTATT GGAATTGCTC CGTTTATTAT 660
TAGGGACCGA GCACCGAAAC GGTGCGTAGG CCCTATTGGA ATTGCTCCGT TTTTTATTAT 720
TATTATTATT ATTATTCCGC CCCCTATCGG GGCACTTTTG AGGGTCTAAA CATGCCCGAA 780
AACTCATGAA AATTTGTACA CACACCAAAT GCGGTGTAAA TAGCAGGTTG ATATGGGTCT 840
CGGAAGTGGG CGTGGCAAAA TGACTCGACA GCGCCACCTA GAAAAATTAA ACGGACGAGC 900
CCCCGATACA CGAATCACGC ACATGCACGA AAATTGGCAC ACACCTCAAA CATGCCAAAC 960
CATACGAAAA AGTCTCTTGG AGCCATATCT CAAACTCAAC AGGAAGTCGG ATATTTTTAA 1020
CTTCCTGCGG CGAAAAAGTG GCGTTTTTGC CATTTCCAGG CGTTGTATTT TAACGAGCTC 1080
CTCCTAGGGA TTTTATCCGA TCGACACCAA AATTGGGTTT TGTCATCTAA AGGCCTTGGC 1140
GATGTTAAAT TGCGAAGCTT TAGAGTTTTC GTCGATGGGC GTGTCCGTGG CGCCCTCGCA 1200
AACTTTGATG ATTCGCCACA AAACAGGAAG TCGTTATAAC TCAGGCATGC ATTAACAGAT 1260
CTGCCTCAAA ATTCACACGC TTGATAAGCG TCCTGACCTG AACACGTTTA CATGCCAATA 1320
TCCAGATATA GTTATAGCGC CACCTGCTGG CCACAGGAAA TTACATGATT TACGGAGTAA 1380
TAAACTCCTC CTACAAATTT TTTCGTATCA GCACCAAAAT TGGGTAGTGT TATCTGAAAG 1440
CTATAGCGAT AATATATTGT GAAGATCTAG AGTTTTCGCA GAGGGGCGTG TCCGTGGCGG 1500
TATGACAAAC CTCAACGCTT CGCCATGGAA CAGGAAGTCC TTATAACTCA ACCACACAAT 1560
GTCCGATCTG CCTGAAACTT CACATGGTTG ATAAACGTCA TCTGTTGAAC ACATCCACAT 1620
AACAATATTG AAGTGGGCGT GGCAAAATGA CTCGACAGCG CCACCTAGAA AAATTAAATG 1680
G 1681