EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44460 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:2137963-2139353 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrrgMA0643.1chr5:2138437-2138447ATGACCTTGA-6.02
Lhx3MA0135.1chr5:2138649-2138662ATATAATTAATTT-6
NR2F2MA1111.1chr5:2137993-2138004CAAAGGTCAAA+6.62
Nr5a2MA0505.1chr5:2138436-2138451GATGACCTTGATCTC-6.32
RORAMA0071.1chr5:2138438-2138448TGACCTTGAT-6.02
Rhox11MA0629.1chr5:2138625-2138642ACTTTGCTGTAAAAAGT+6.08
Enhancer Sequence
GTCAACAAGG GATGTTGTCA AATGTCATGC CAAAGGTCAA AACACAATGA ACTTCCTTAA 60
AGTCAGTCAA AGTTGAACTT CTTGTTTTTA CTCAAAAGGC ACAAATCAGC ACTGATAAAT 120
AAAGTGTTCA GTGTTCATTT CTACTCAGAT CAAAAGTCTT TCTCAGGAAT GTGCAGCATT 180
CGTCATCTTT CCAGCTCAGA GTCCAAGATA CTTGCAAAAT TCAATAGAAA AATGTTGAGC 240
CTGATATTTG AGCAAACAGG CCCGAACATG AACATGCAGG AAAACAAAAA CACACTCATA 300
GGTTATCAGC ACAGTCTGTC ACTGTCAGTT GCTTCACACA CACACACACA CACACCTGTA 360
TGAGCAGAGA GACATTTAAT AGTGTAAAGC AGCGGCTCCC ACAGTGTGTG TGTCTTCATG 420
AACACACCCA TGAAAACACA CGCTGTGCAG AGCTCCTCGC TGTGCTGTGC TGAGATGACC 480
TTGATCTCCC GCTACAAGCT GACTAATAGG ATGAGCTTTG ATTTACAGGA AAAGGAAAGT 540
AAAAACTCCA CAGGCCGCCT GAGCTCAGGG GAAACACAGG TGATGCATAC ATGCTGACAG 600
TGTTTACTCC AACCCCAAAA ATAAAATAAA AGGTCAGCCA AGTATATCAT TGCTCAGAGC 660
AAACTTTGCT GTAAAAAGTT GATTCTATAT AATTAATTTG TACAATAAAG CTGTATATGA 720
AGAGTTAATT TGCAACAAAC TTAGTTATTT TTATAAATAT CATGTTACGT TGTGCATTAG 780
AGTACAGTTG CAAAAAGGGA AATTACTTTC ATGTTCAGTA TTTAACAATT GCANNNNNNN 840
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 900
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNCACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACGTGT GTTTGTCTGA TTGTGAGGTG 1020
TGTGTTCTGA TCTTGTTGAC AGTGTTGATG TGTGTTTGAC TGATTGTGAG GTGTGTGTTC 1080
TGATCTTGTT GACAGTGTTG ATGTGTGTTT GTCTGATTGT GAGGTGTGTG TGTGTTCTGA 1140
CCTTGTTGAC AGTGTTGATG TGTGTTTGAC TGATTGTGAG GTGTGTGTTC TGATCTTGTT 1200
GACAGTGTTG ATATGTGTTT GTCTGATTGT GAGGTGTGTG TTCTGACCTT GTTGACAGTG 1260
TTGATGTGTG TTGGTCTGAT TGTGAGGTGT GTGTTCTGAC CTTGTTCACA GTGTTGATAT 1320
GTGTTTGTCA GATTGTGAGG TGTGTGTTCT GACCTTGTTG ACAGTGTTGA TGTGTGTTGG 1380
TCAGATTGTG 1390