EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44276 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:71730097-71731138 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ARNT2MA1464.1chr4:71730498-71730508GGCACGTGAC-6.02
ATF3MA0605.2chr4:71730654-71730666GATGACGTCACG+6.02
JDP2(var.2)MA0656.1chr4:71730654-71730666GATGACGTCACG+6.22
JUNB(var.2)MA1140.2chr4:71730654-71730666GATGACGTCACG+6.14
Enhancer Sequence
CTATGATAGT TTTATATGAT TCCACTATTT ATTATTTGCA AAGAATACTT TTCTGAAATT 60
ATATTAAGGT TAAAGTCCAA ATGTGCAAAC ATAAAACCAG CTTCACCTCA GTAAGTCAAT 120
AGGCTGACAG NNNNNNNNNN GAATTCAGTG CTTAACTGAA AACTCAGAGT AGCTACAATG 180
TAAACCACTA TCATTGAAAA CTTGCGTGGA GTTTTAAAAC TACACATTAA ACATAATACA 240
TTTAATTTAG ACTAAATGTT CTCATTATTC CGGATTATAT ACGACTGAGG TGTAAATTGT 300
GTTTAAATAT GAGGGTCCAG CGCCGCAGCT TTCCTGTTAC TCGCTTGTTT TCGTTGATGA 360
CGTTACTCAA AGCGCTGCAT GTTAAATAGA GTAGCAGTTC AGGCACGTGA CATCGCTTGT 420
AAAAATATAA CAACTTGTTT ATATTGACTC AAACTGCAAG AAATCGCTAC AAAAATCTAT 480
TAAACTTAAT TTAAAAAAAG CTTTATAACA AACCTTTCTC AAGCCTCTTC ACAACATTCG 540
CAGGAGCGGC GCGGATTGAT GACGTCACGT AGATATTCTA GATAAATCAA AATAAAAGTC 600
CTGTTCCCAG CCTGCGTCTA AAACGATCAT TTCCTTGATT AAAATAAGTT AAATTCATGT 660
TGAAGCACAC AGTTTCTTTT CAGCAGATTA TTGGACAGCG TATATTCACC TGAGTGTGAA 720
TGCGAAGCTA CTTTAACTTT TTTAATTTAG CTACTATCAT TTGCCTATCA AAGATGTTAG 780
TGAATAAATA TATATGCAAC TTAGAAGCTT TGTAATGTCT TATGTTTGTT TTAAGAGTCC 840
AAGACACGAC ATACAGAAAA CTCAGAACAC ATAATAAGTG ACTCATTGGT TAGCACTGTC 900
ACCCTCATAG AAAGAAGTTT GCTGGTTCGA GTCCGCACTG GGTTATTTGG CGTTTCTGTG 960
TGTTGATGTC CTCCGGGTGC CCACAGGTTC AAACACATGC GCTATAGGTG AATTGAATAA 1020
ATTCAATTGG CAGTGTAGTG T 1041