EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44242 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:60218624-60220516 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr4:60219966-60219982GCTTGAGTAAACAGAC-6
KLF9MA1107.1chr4:60220175-60220188TGTGGGTGTGGGT+6.32
KLF9MA1107.1chr4:60220453-60220466TGTGGGTGTGGGT+6.32
NFYAMA0060.3chr4:60219001-60219012TCTGATTGGTC+6.14
NFYBMA0502.1chr4:60219002-60219017CTGATTGGTCAAATG+6.14
NR2C2MA0504.1chr4:60218855-60218870TGACCTCTGACCCGC+7.26
Nr2f6MA0677.1chr4:60218855-60218869TGACCTCTGACCCG+6.47
RXRBMA0855.1chr4:60218855-60218869TGACCTCTGACCCG+6.34
RXRGMA0856.1chr4:60218855-60218869TGACCTCTGACCCG+6.49
Rarg(var.2)MA0860.1chr4:60218845-60218862TGAACTTTTTTGACCTC+7.02
RxraMA0512.2chr4:60218855-60218869TGACCTCTGACCCG+6.41
Enhancer Sequence
CTTTATGAGA TTTTCCAGAC ATTTTTCTCC TATAAATTAA ACGGTTTTGA ATTAAAGTTT 60
CCAAATTTGA AATACAACAC ACTAAAACAT TAATTTGTGC AATTGTGTAG TTTTTCCTAC 120
CTTTTTTAAG AAATCACTAT CTGAAAAAAT CCTTTACTGT AAGCAAAACG ATGCTGTGCT 180
CTGTCGAATG ATGCTGTTCG TTGAATATCA CTGATGGTCA ATGAACTTTT TTGACCTCTG 240
ACCCGCCTCC AGAGGACCGC GTCATTCCTT CGTGTACCTT CGGCTCAGTT CGGAAAATTG 300
ATTGACATCT GACTAACCTG TTTGACTGCA CACCTAGCAG TGATTCTCCT CCCCCCCGGC 360
TTCAACATTG TCTCGACTCT GATTGGTCAA ATGTTGAAAA TGTTGAGAAT TCCGGTCCGC 420
GATTTGCTGC AAATGTTGAA GCGCTGCAAC GTGATTGGCT ACAATGTTGG AGCGAATCGC 480
TCCGATTGGC TCTCATCTTC AAATATTGTC GGACTATCCT TCGGCAGCTG GCGTTCAGGC 540
TCCTGTCTCT TCGGGGGCGT GGGTTCGAAT CCCACAGCTG CCAGATGTGG TTTTAAACAC 600
GGCCAAACTG CTTGAGTGTG TGTGTGAGTC TCAGTGAACG CTGGAAATGA GAGAGTACAT 660
TTAGGTTGGC AACTAGTCAG TATAATGTGT TCTTTGAAAC TCACGGCAGA CTTGTTGGTG 720
TGACAGCAAC ACATCCCCAA GCTCGAATCT GCTCAGGAGC AAGTGTCTTT CCCACGATTA 780
GATTGCAGCA TTTTGAAGTC TCTTTGCCAT TGCTCCTTTT AGCAAGAGCA CCCTATTGAA 840
ACAGGAACAG TAAAGATTCA CAATTAGAGT AGTAATACTC TATAACTGGA TTTGAATATA 900
ATAACAACAA TGTGGGGTCT GCTGTGATGG AATCAGTAAC TCACTCTTTT GTGAAATAAC 960
AGTTACCTTG TAATCAGGTG CTTAAATGCA TCGCAGCTGA CTGCCGTTTG GAGTAGACTT 1020
CAAATGCCCT GAGGTGTGCT CTAATAGAGA CAGAACTGTG GTTGACAGGA AGGTGGGAGT 1080
GCTTCCTAAG CTGGTATTAA GCAGCTCTCT TTCTTTGTGG AGGAGCTCCA GCAATGCATG 1140
GCCAAATTCA ACTGATTTCC CAGCGCTGTT GCGCTTCTTG AAACAAGTTG GTGTGAAAAC 1200
TGCTCATGGA AAGCAGCTTA GCAAGGTAGC GTGGCCGAGC GGTCTAAGGC GCTGGATTAA 1260
GGCTTCAGTC TCTTCGGGGG CGTGGGTTCG AATCCCACCG CTGCCAGGCA GTCCTTTTAG 1320
GATGCTTGAG AATGACCTCT CTGCTTGAGT AAACAGACTT GCAAAGTAAT ACTGCATGCT 1380
TCCGCTCGCA TCCAAACGTA GACTCCTTGG CCAAAGTTGA AGGGCTTCAC TAGGAAGCTT 1440
GGCGTTCTCT CTGCTTCCGT AAAGTTGGGC AGAAAAGGGA CCACTGCATG GAGTCATCTG 1500
GGATAGCGTA GTCAAGGGAT TTTAAGTGCT GGATTTAGGC TCCAGTCTCT TTGTGGGTGT 1560
GGGTTCGAAT CCCATCCGCT GCCAGGCAGT CCTTTTAGGA TGCTTGAGAA TGACCTCTCT 1620
GCTTGAGCAA ACAGACTTGC AAAGTAATTC TGCATGCTTC CACTCACATC CAAACGTAGA 1680
CTCCTTGGCC AAAGTTGAAG GGCTTCACTA GGAAGCTCGG CGTCCTCTCT GCTTCCGTAA 1740
AATTGGGCAG AAAAGGGACC ACTGCATGGA GTCATCTGGG ATAACGTAGC CAAGGGATCT 1800
AAAGCGCTGG ATTTAGGCTC CAGTCTCTTT GTGGGTGTGG GTTTGAATCC CATCCGCTGC 1860
CAGGCAGTCC TTTTAGGATG CTTGAGAATG AC 1892