EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-44048 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:28345808-28346955 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr4:28346450-28346460AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr4:28346450-28346460AACACGTGTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:28346936-28346949TAATTAATTATCA+6.08
Enhancer Sequence
TCTCCGAGAG GTGCAAGTCG AAACATCCCA TGAGAGGAGC GCAGAGGAGA AGGTGAACCC 60
ATAATAACCA ACACATTACA AGATCCATGG TGTAAAACTC CGCAAACAGG CAGAAAACAC 120
GTCAGCTCTC CTTCTGCCGG CACGTCGACC TTCTTCTATC CTTCATTGTA GCTTTTTAAC 180
AGCAGAAAAC ACAGTTTATC GAGGTGGTAT CCATGGAGCC AAGTGACATT ATCCACGTTA 240
AGTTTTAAAT GAGGACAAAA TGGCTCCGAG TGTGCGCGTC TCTCCCCCCG CGCGCGCACA 300
CTCACACACA CACACACTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCACA CACACACACA GTCATTAACA 360
TAAACCTGCA GTGCACCTCT TCACGGGACT AAAGAATAAC TCTCTCATGG AAATTCAACT 420
ATTGTTATTC ACCGCTGCAC TTTTGGTGAC TTTTACGCCC CAAAGTAAAC GTAAGAACTG 480
AACGCTCTTT TTACAAGTTT AATACAACCG TCCGAGATGT GGACGCGAAT GCTTTCGCTA 540
TAAACGTCGG TATAGTTTAT TTCAAGCGAC TTCTTGGTTG TTTGCTTCGG TTATCGGGTA 600
AAGTTTTCAT CTCTTTGTCT CTTTAAGTGG ACATGAATTC GCAACACGTG TTTAAATCGT 660
TCCATTTACA AGCGGCTGTA AAGTAATAAA GGCATCAGGG CTGGACTGAG TAGTAAAACC 720
AAATTACGCA TGAATAAATA ACTAGGCTAC TTATGTGTTA CAAAAAATAC GAGAATTAAA 780
CAATGACAAC AATGGAAGCA TTGTCAAAAT TAAATGTTTC CTAGCCCCCT AAGTTTTGCG 840
AAACGTCTGT TTAAAATAAG CTATTTAAAA TAGCCTAAGT GTGGTGCAAA AGGAAACACA 900
ACATATTTAT TAATTGTATA ATTTATTTTA CAGTAAATAA TTACCACCCA TCATTTTTTA 960
AGTCATCTAT TTCTGTTGCA CATGTCAAAA TTATTATCTG TTACCATATT AGTAAAAAAA 1020
TAAAAATAAA AAAACGGATA ATAGGCTATA AGAGAATACT TTGCTTGTAT TACATTTACA 1080
TTTGCTTTTA TTAATTATCA TAACATAGGC CTACTATATG AGACATGGTA ATTAATTATC 1140
AGTGTCG 1147