EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-43908 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:24197909-24198751 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr4:24198110-24198120GACAGCTGTT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr4:24197917-24197930GAAACCACTTAAA+6.52
PKNOX1MA0782.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA-6.37
PKNOX2MA0783.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA+6.22
TGIF1MA0796.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA+6.14
TGIF1MA0796.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA-6.37
TGIF2MA0797.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr4:24198480-24198492AGACAGCTGTCA+6.27
Enhancer Sequence
CATAGGCAGA AACCACTTAA AAATTCTCAG TATATCAGGA TTTACTGGAT TTGTTAGGTA 60
TCGGTTTGAG TATATTGCTA ACTTTAGTTT TGTTCTACAA GTGTATGACA ACATTTATTC 120
CAGATTTCCA ATATATACCA GTTTTTTGAT GATGTTTTTT TTTTTCAGAA AATGATAAGA 180
ATAACAACTA TTTACATAAT TGACAGCTGT TTTTGACAGT AAAACTGCTC TGATAGAAAA 240
GATTAAGTAG TTTAGGGGTC GTTTGGGATT TTTGTTAACA CGCTGAAAGG AGCCCCCCTC 300
ATAGCATTTT GCTTCAGGAC CCTAGACATC TACAATCAGC TCTTGTGGAT AATTTCTGCG 360
AAAGATATTT GTAAATTTAG CCAAGAATTG ATAATTACAG TCCTCTAGGG ACTTGAGAAA 420
ATGGCTTAAA TCCATTAGTG TCAGTGGTTT CTGATTGATT AATAGGGGGT CTTTCAATTT 480
GGATGTTGAT GTTAAAAAAC GTCGGATTTG AAAGGGTTAA CGTCGCGAAG ACTTGCGTGC 540
GCACACAGAC ACATAGTTAG TACCCTGTAT TAGACAGCTG TCAGCACCCT CTGATTTGGT 600
TTGTCAGAGC TTTGACATTT TGACAGGCAC CAAGACGGAC TGCTAAACTC TGAGAGCAGC 660
ACGCAGGCGT TCTACAGGGC AATCACAATG CGAGGGCCCG TCGGAGGCCT GTTATTAAAG 720
CGTCTGCGAC ACCGTCACCG CGAGACCCGC CGGCTAATGG CAGACTGGTT GCACGGTGTG 780
TGCGGGGGGT CCTTCTTAGT TTGACCCGTT TGGCCAGGGG TGGTTTTGGC AGTGCCTGAC 840
AG 842