EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-43333 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:13972642-13973828 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Dmbx1MA0883.1chr4:13972917-13972934TAACTTAATCCTTTTTA-6.47
HOXA13MA0650.2chr4:13972971-13972982CCCAATAAAAC+6.62
HOXB13MA0901.2chr4:13972971-13972982CCCAATAAAAC+6.62
HOXD13MA0909.2chr4:13972971-13972982CCCAATAAAAC+6.62
NFICMA0161.2chr4:13972724-13972735TCTGCCAAGAA-6.02
POU2F1MA0785.1chr4:13973583-13973595AATTTGCATAAA-6.11
POU3F1MA0786.1chr4:13973582-13973594AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr4:13973582-13973594AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr4:13973582-13973595AAATTTGCATAAA-6.78
POU5F1MA1115.1chr4:13973583-13973594AATTTGCATAA-6.14
POU6F1MA0628.1chr4:13973475-13973485ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:13973475-13973485ATTAATTAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr4:13973580-13973596CAAAATTTGCATAAAA-6.3
Enhancer Sequence
ACAGTGCCTG GTTGTCAAGT TTAGGATGTA AAAGTTTCTC TGGTCTAATG TAAACGGAGT 60
TTGATGTGCT ATAATCATCA GGTCTGCCAA GAATTGACAC ATCCAGTACA ATCGATTCGT 120
GTTGGGACGA CATGAAGGAT TTAACTTAAC TTAGTTTTTA CTAATTTAAG TGAATTGAAC 180
ATAAAACAAT TAAGTTGTCC CCTTAAAAGT TAGGAATTGT GTTTCAGCTT ATTAAAAAAT 240
ACACTAAGGA TGCTGGGTTC CACACAACTA ACAGATAACT TAATCCTTTT TACAAATTGA 300
AGTGGATTGA ACATAAATTA TTTGGTTGTC CCAATAAAAC TTAACAAATG TGTTGTTTCA 360
ACTTTTAAAA TAAGTAGTTC AAACAAGCAG CAAAACATGT TAGAACAACA TAAAGTGATT 420
AAGTTAACTT ATTAGTTTTT ACAAATTTAA GTGGATTGAA CATAAAGCTA TTTAATTTTC 480
ACGCCCCGAA AAACAAGAAT TGTGTTGTTT CAGCTCATTT AAAATTAATA GTTTGAACAA 540
ACATAATTAT TTTGACTGTA TAAAAACTAA GCAGAGCTGA AAAAACTCTT TTTATAGGGA 600
TAATTCAGGC TTTATTAATT TATTTTGGTC TTAAATATTT ATTTGGTCTT AAATACTAGA 660
GTATTTCTTT GTTAACTAAA TAAAATAAAA CATGCGCTGT AAATGTTCAG TCATGCTTTG 720
TGTCATATAT GCTTGGATAC AAATAGAGAT GTAACAAAAC TGCTGTATCT TTAATACACC 780
TGCCATTGTA ATTGTATTAA CGAAATGGGA CATGTCTCCT TGTATCTAGA TTTATTAATT 840
AATAATAATA GATTTTTAAT TCATGTTACA TTTAAATTTA TATAAGATTT CTTTATAATT 900
CTACTTTTTA AATTGATTAA TTTAGCAAGT TTCAATTACA AAATTTGCAT AAAACTCAAC 960
ATCTTACAAA AATCCTAAAC GTTATTACTA TAAATGTTAA GTCACTCTAT TTTGATGGTC 1020
CATCTATTGA ATTTAGGTTA CATTGCAACT ACATGCCAAC TTATTCTCAT CAGGTTTTAA 1080
GTAGACTGTT GGGTAAGTTT ACATGTACTT GCAAAGTTTC TTATAGTCAG TTAAATGTCT 1140
GTTGAAGGAG AAGTATCAAC AGATAATAAA CAGAAAGTCT ACTAAT 1186