EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:8107023-8108197 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr4:8107086-8107099ATTAAGTGTTTTA-6.16
Nr5a2MA0505.1chr4:8107200-8107215AATTTCAAGGTCAGT+6.64
RESTMA0138.2chr4:8107239-8107260CTCAGCAACATGGACACCTCC+6.39
Enhancer Sequence
GAGAAAAATT ACAGCAAAAG ATGGTTCCAG CATATGGCAG CTATGCCACA CTTTTCTAGC 60
AAAATTAAGT GTTTTACTTC CTGATGTAGG GCTGCACGAT TAATCAAAAT AGAATTGAGA 120
TCTCGATTTG ACCTACACAC AATCTTAATT CAGCTTTTCT ACGATTCAGC AGATTATAAT 180
TTCAAGGTCA GTCATCATAT TGTTTTATAT ACATTGCTCA GCAACATGGA CACCTCCAAA 240
TGGTGTTAAA AGTGTCACAT ACTGTATTTA TAGGTTATAA TTCATCCAAA AATGTCATTT 300
CTGTCTTAAT GCAATGACAT ATTCACAGCC GCGAAATCTC TTTGTTTACT AAGAGAGGAC 360
GAACGTGTGC CCGTAAATGA TGTCTACTTC AGTGAACAGA ACCTGCATAA AGGCTGTGTA 420
ATAAAGTTGT AAATAACGTT CAGTTTGTTG CACAGCCTGA TCGTTTGGGA GCCGCGTGGG 480
AAGTATGATT TTTCATGTAT GTTTTTCCCT CAAAGTGACG GCAGAGTCTA ACCAAAAGTG 540
CCCACATCAT TTAAATGATC ATATTTTACA GTTATGATTA CGACAAGATT TGATAGGTTT 600
TTTCTTTCAT AGCGAATACA GTGTTGTGCA TGAAAATAAA TGTTTAAAGG GTCATTATAA 660
CTACTCTAGC CTATATAATT TTGAATATAA TGAAAGAGGG AACCCTAACT TCAGAATTCT 720
GAAAAGTTGT ATTCTGATGT CATCACATTA CTGTGCATTA ACAACCAGGA CATTTTTAAA 780
GTCTGCTCAA GTCCACCATT CAAAATGTAT GTAAAATTTA GCATTTTAAC CAACAGCAGG 840
CCTACACATA GGCCTAATAT TATTATTGTT GTTTTATCAT GTTTAAGAAA TAACAATAAT 900
AACAGCCTGC TCATATTTAC CTTTATTTTA CATCTACAGA GTTGTGAGAA TATCATGATC 960
TTGATTTTAA GCAAAAAAAT CATGATTGTC ATTTTAGCCA GAATCATGCC GCCCTAACCT 1020
GATGTATTAA AAAGGCCATG AAAACTGCTA GAGTCACTGC ATTATGCAAG CCAGGCCAAT 1080
AGTTGTTGAT GTGGCTTTGT AAAGGAAAAC GACTTGCATG CGCAAATACA ATCTATCACT 1140
ATGATTGACT ATAGACGTAA CATGCATGAC TGAT 1174