EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42876 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:6495776-6497166 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr4:6496473-6496489ATTTAAGTAAACAAAT+6.09
FOXC2MA0846.1chr4:6496151-6496163TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr4:6496476-6496488TAAGTAAACAAA+7.22
FOXP2MA0593.1chr4:6496477-6496488AAGTAAACAAA+6.62
Hmx1MA0896.1chr4:6496910-6496927ACCAGCAATTAACCCAC+6.14
POU1F1MA0784.1chr4:6496648-6496662CTAATTAGCATTTT-6.51
TEAD2MA1121.1chr4:6496390-6496403CCACATTCCAGCA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:6496217-6496229ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr4:6496216-6496228TATAAAAAAAAA+6.92
Enhancer Sequence
CTCATTTCGC ATTAAAATAT CAGATAAAAA CACAGGCTGA TCATCAATGA GCGCAGACAG 60
GGCCGAGGAG GACCCGGAGG GACGTGGGAG AACAGAGCGA GAGTGATGCT GGCGTCGTCT 120
CATCCCGCTT CCCCCTTCAA GCACATGCAA ATAAGGCTGT GATGCTTAAC TGCATCATTT 180
ATGGGGATAA TAGCGGCATC ATCATTACGG GACTCAAATT AAATTACATC ACAATTAGCA 240
TAACAAAGTG ATTGGTTAAA CTTTCAAAAC AAATACCCGC CTCGGCTAAT GAGCGGTGTT 300
AATTGGAACG GGCTCTTTCT AAATAAAACA TGTAGGTAAA CATGTGCTTT AGTTAAACGA 360
CTTTTTAGGA TTTGTTTTGT TTATTTATTT GAGGATAGGA ATAGGGGGAA AAAAAAGCTC 420
ACCAGGGGGA ATTTGCAGTA TATAAAAAAA AAACACAACC CCCTCAAAAT ATGCAGCATT 480
TAATTTTATC GCACTAAACA AGCTATTACA CTCGGGCTCA GGAGGACAAT GTAAATTATC 540
TGTCTGATTC TCCATATGTG CTAATCATGT ATCTCATTAT GCACCGGGGT ATTAAATTAT 600
AAAGACCACC ACGTCCACAT TCCAGCACAA AGCCATATAA AAACGTAATA ATATGCTCAC 660
AATAGCCCAA TAGCGTGCGC CGTTCACCCT TATGAATATT TAAGTAAACA AATTATCTGC 720
CTGCCTTTGA TAGGGATAAT TAGTACTCCG GGGCTAATCA TTGTACTGAC CCCACCTCCA 780
AAAATGAGAC AGGCTAGTTG AAGTTTTAGG TGACTATGAA ATCTTAAGCC ATTCTCATGA 840
AAGTACTAAA TGAATAAATG ATAAAAGCTC ATCTAATTAG CATTTTATAT TTATTAGCAT 900
ACAATCACAA TAAAAAAACA AAACAATAAT ATTTAACACA CAATAAAAGC ACTCAAAGTA 960
TTTAATTTCC CATCAAACTC CACAAACAGC TCAACTGAAA TCACCTACTA GGCAAAGTCG 1020
CACCACACTG TTCTTCGGCA GGAGAAACAC ACACTCTTAC ACACACTTAA CGACACGCGC 1080
GCACACACAC ACACGCCGCA CAAAACCACA TTCATTATCG TCATTGCCAT TATCACCAGC 1140
AATTAACCCA CAGATGAAAG CAGCCCACAA ACCAAGCCGG AGCACGCGGC AAGCCTTAAG 1200
GAATGACAGC GAGAGCGAAC AGACCCTGAT GCATGGATGA AAGTAGGGAA AGCGTGGATG 1260
GATGGAAGAA AAGGTGGCTT TATTACCTGC AGGTGAGCGG TGTGGGACGG CTGGATGGAG 1320
AGGGTGTTTC GCGGAGAGTC GGGCGTCACG GGAAAGAGCG TGCGATTATC AGTGTCATCA 1380
CTCCAACTGT 1390