EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42846 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:6043296-6044282 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:6044162-6044181TTTCCAGCAGATGGTGCTA+6.21
DMRTC2MA1479.1chr4:6043896-6043908CATGTATCAATT-6.62
HLTFMA0109.1chr4:6043732-6043742ATATAAGGTT-6.02
IRF1MA0050.2chr4:6044029-6044050AGAGATAAACTGAAACTAAAG-6.11
NFIL3MA0025.1chr4:6043737-6043748AGGTTACATAA-6.14
Enhancer Sequence
TTGACTTTCT CAAGCTAACA TGTTCATTAT ATTTTTGTCA TAAGTAGATC CCTGTTATAA 60
CGTGAGTTCC TGATTATCTA GACCAGGGGT GCCCAAACTT TTTCGTATGA AGGACCAAAA 120
TGCAATTATC ATTGAGAGCT GTGGGCTGAA AAGAAATATA CCAAACTAGA TTACATTAAA 180
GTTGCCATGT GTAACTTTCT GATTCATTTC ATAATATTTA TTAATAAATA GAAAGCATTA 240
CTTTGAATCA TATTAACTAA TGCAGTATAA CTTTAATTAT AATGTATTTG CAATTAAAAC 300
AATCATAACA GTGTAGTTGA GTGCTGTATA CACTAGTCTA GCAGAATCTG CCTCTGCATT 360
GATTCAGTCA CCAGTCTCTG CATTGTCGCT TATGATTTTA GTTAGCTTTA TTGTAGCTTA 420
ACAATAAAAC AAACTAATAT AAGGTTACAT AAAATTTGAA ATGACAATCT CTAAACCATC 480
TCCATCATTC TCCTTCTCTT CTCAGATGCG ATGGTTGGCC AAATCAAAGG TTACCGTGGG 540
CCAACTTTAG GCTCTAGTTT GGGCATCTCT GATCTAAACC ATTAAGAAGT TTATTAGTAA 600
CATGTATCAA TTGCTGACTG ACCGTACTCA TTAAGTATGG ACAAACAATA ATTGCCTCTA 660
TTGCTAAAGT TAATTTCTCA CTCTTATAGA GAGGCTACTG AATTATATAA TATTTAAAAC 720
GCACTCGTTA AACAGAGATA AACTGAAACT AAAGCTTCCT CAGACGTATT GCTGTTTATA 780
TTCATTTGAC TGGGTAAAAT GCATTTGTAT ATTTGTGTGT TGCTGTTACC TGTGGTGTGG 840
TGAATGTGTT CCTGCAGTGT TGTGTGTTTC CAGCAGATGG TGCTAATAGA CTGAGCTCCT 900
CATATTAAGC CTACACAGTC AGTCATTCAG TCTAAACAGC CTCTGGATCA GGACTCGCTC 960
AGCTTCTGTA AGTCTGTAAG TCTCTG 986