EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42840 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:5946155-5947363 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:5946325-5946340CCAGGTCAGAGGTCA+7.49
Nr2f6MA0677.1chr4:5946326-5946340CAGGTCAGAGGTCA+6.67
RFX1MA0509.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA-6.64
RFX1MA0509.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA+6.65
RFX2MA0600.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA+6.45
RFX2MA0600.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA-6.59
RFX3MA0798.1chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA+6.14
RFX3MA0798.1chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA-6.46
RFX4MA0799.1chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA-6.32
RFX5MA0510.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA+6.18
RFX5MA0510.2chr4:5946764-5946780TGTTGTCATAGCAACA-6.4
RXRBMA0855.1chr4:5946326-5946340CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr4:5946326-5946340CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr4:5946326-5946340CAGGTCAGAGGTCA+6.27
Enhancer Sequence
AGGAAAGATC AAAATCTGTT CTTGTTGACT TTATTATTAC GATTATTTGA ATCAGTTTTT 60
AATCTTTGAC ATGATTTTGA TCAGTGAATG AAGTTAAACA TGACCTAATG TAGTGATGTG 120
TTCAGTTAAA GCGTCCGTCT CTGTCAAATC TGTTTTCAGG ATCTACTAAA CCAGGTCAGA 180
GGTCATGGAG AGCTCTCGAG TGGATCTGGA TTCCTGCTGG ATTGGAAACA ACTGTTTCCT 240
GAGTTATTTG TCATGTTATG TGTTAATTCT GTTTAAAATC ATTTCCTTTG TGTGCAGGAG 300
AGACTTTCTG TGTAGCAGCA GCTGCCAGTC TGCATGTAGA TTACACCAGT ATTAACCAGT 360
TTCCGATTAG ACGGCTGAGA GTACAAGAAA CAGCCTTGAG GATGAAACAG GTGGTTCTTT 420
GTAGAGCTGC ACGATATTGG AAATATGTCA CGTTGTGATA TTTAGTTTTC TGTGATTTAT 480
ATTGTGATAC GAGTACAAAT TCACCAGGGG TCCGTTCTTC GTACGTGGAT TACTCAGTTA 540
GCTGGATTTG GATATTGACG ATTTGACACG ATCCAGGATC GTTTCGTTCT TCAAAGCTGA 600
TCCGAGAGTT GTTGTCATAG CAACAGTTCT GCTAGGTCAA ACCTGATCGG GAGCAGGTTC 660
AATTCATATA AACAGGATTA GATCGGCTCA GTTCAAGCAA AGATAATACA GAAAGTATGT 720
TCCGAATTCT GATATTTTCT TACAGTAGTA GTTATATACA CTTGGGAAAA TGGTAGATAT 780
TTTTTAACTA TATATATAAA GTAATAGTCA TTAATAAAAT AAATAAAGTT ATACATATTA 840
ATAAAACGTA TGCAATCTGC ACCCTCGAAA TGAAAGTACA AAGACTGCCA CCTTGTGGTG 900
CAAATAGAAA ACTTATTGAT ATGAACTTTT TAGATCACTT TAGTACAAAT TGTGTATAAT 960
AGAAATGCAC AATATGTGAC TTTTTTTTAA AGCAATAATA CATTTATGCA GTCATAAACA 1020
TGTTTTGATA GTTAATATGC CGGTGATTTG ATGCTTCACA AAAGTTGCAG ACACCTTTAC 1080
CAATATGAAA ATGCTTTTGT AAACAACCAG TTATTCTTTA CACCGATTAA GAAACGGCTA 1140
CTATAATAAA GAAAATCTTT TCTAAATGTA GAGCTAAATA CACTGATTTG CATTGAAATA 1200
CATGATGA 1208