EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42811 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:5534315-5535956 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr4:5534785-5534797TGCTGTGATTGG-6.02
NFYAMA0060.3chr4:5534746-5534757TCTGATTGGTT-6.62
SPI1MA0080.4chr4:5535301-5535315GCAAAGCGGAAGTA+6.04
SPIBMA0081.2chr4:5535303-5535315AAAGCGGAAGTA+6.37
SPICMA0687.1chr4:5535712-5535726TTCTTCCCCTTTCT-6.03
SPICMA0687.1chr4:5535301-5535315GCAAAGCGGAAGTA+6.11
TBX19MA0804.1chr4:5535112-5535132CTTCTCACCTTTGTGTTATT-6.04
TBXTMA0009.2chr4:5535114-5535130TCTCACCTTTGTGTTA-6.08
ZNF384MA1125.1chr4:5535858-5535870GTTAAAAAAAAA+6.04
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ZNF384MA1125.1chr4:5535859-5535871TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
AGAGGGGAGA AAACGAAAAA TAAAGAGGAG AATAAAGGAA TAGATGGCAG CGAGGGAGGG 60
TGGACGGGGC GGAAAGAGAG AGAGAGAGAG CGATAGAAAG AGGGAGAGAG TGTGTCCCTG 120
CCAGGACTCA CGTAGACCCA CAGCTGCAGA GCCTTTCTGA TCCCAGTACC TCCCTTCACC 180
CCTCCGTCAC GCTCCCAGAG CTCAATATGA GTGAGTGTGT GTGCATGTGT GTGTGTGAGA 240
GAGAAAGCGC CCTTCTATTT GTAGGTCAAG CTGTTTAAAT AACCTGATTG TCTGGGTGGC 300
ACCAAACAAA CTCAGCAACC GACATGAGTG GCCGATTCTC AAAGTTACAC TACACACCAC 360
ATCTATCACA CACTGTATAT ACATGCAGAG CTGGGTTTTA CATGACATCA GACCATCCCT 420
TAATGCTGTA TTCTGATTGG TTGCTCCTTT GGTCTTTTCT TTACGGGATT TGCTGTGATT 480
GGTTGCTTGT TGGCTTTGTG TCTCTTATTG GCTGCAGCTT AACAAAAGTG ACTTCTGGAC 540
ATCATCAGAA AATAATCCAG TAAATGAGGA TCGAGACTCT GATATGATAA GTAGAGGCTG 600
GTGTCTGTTT ATTAGCCCAT ATATTCATGG ACTTAAAGTA ATGGAAATGT TAGCTACAGA 660
GTCTTATATG GAATTAAATG GAAATGGCTT TCAGTTTATG AAGTATAATG GTTATTATAC 720
AGATATATTT GACCAAAGAC TGACAATTGA ATTGAGTTAA ATGGATGGTT CATGCAAATA 780
GGACGATTCC ATCATCCCTT CTCACCTTTG TGTTATTAAT GGTTACTTGC TGAAATAGAT 840
TTTAAGAAAT GTTTAAATGA AACCTGTGAC ATTTTTGTCC CACTATTCGA AAAGTTCCTA 900
AATGCACCAT AAAACTAATC CACATGAATT ATGTGGTTTA ATCCAAGTCT TGAGAGGAAA 960
AATAATCGCT TTATCCAGCT TATTTGGCAA AGCGGAAGTA TAGTAAGCTA TTTTCTGAAC 1020
GTGTGAGACT ACATAATCAG AGAAGAAGAA AATGCATAAA ATCAACTCCA ATCCAGTCTG 1080
TTTATGGACA CGATAATAAT TGCAATAAAG TTTGCAGCAT TGTGCAACAT ACTGAACTGT 1140
TTTTGTACTG CAAAATTAAT GATTAGTGGA TAACGTTAAA AGCAGTGAAC ATTCAAGTGA 1200
TAAAAATGTA TTCTGTAAGA TATAATTTGT GTGACAAAGA TGAAAGATTC ATGGTTTTGC 1260
AACACAAATA TGAGTAAATT ATGGTTTTTA TTTTTGGTAC AAAACAAATC TTTTTAGGAA 1320
AATAAGCTTT ATAGTATAGA CCCAAATGTG TTAGATACTT ATACAAATAC ATATATATGT 1380
ACACTGTTAA ATCATCTTTC TTCCCCTTTC TCATGCTCGG TTTGAACAGC AGCACATTGT 1440
CTTGACCATG TCTACATGCC TGAATGCATT GAGTTGCTGC CATGTGATTG GCTGATTACA 1500
AATTTGCGTT AACAATTGGT TGAACAGGTG TACCTAATAA AGTGTTAAAA AAAAAAAAAA 1560
AAAAAAAAAA AAAAATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 1620
ATATATATAT ATATATATAT A 1641