EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42615 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr4:1706397-1707581 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:1706468-1706483CAGGGTCAGAGGTCA+7.8
Nr2f6MA0677.1chr4:1706469-1706483AGGGTCAGAGGTCA+6.93
RARA(var.2)MA0730.1chr4:1706477-1706494AGGTCACGTCAGGGTCA+7.46
RXRBMA0855.1chr4:1706469-1706483AGGGTCAGAGGTCA+6.87
RXRGMA0856.1chr4:1706469-1706483AGGGTCAGAGGTCA+6.68
Rarb(var.2)MA0858.1chr4:1706477-1706494AGGTCACGTCAGGGTCA+6.74
RxraMA0512.2chr4:1706469-1706483AGGGTCAGAGGTCA+6.73
ZNF410MA0752.1chr4:1706841-1706858TTGCATTATGGGATGTT-6.03
Enhancer Sequence
GTCTGTAGGC TTGACCCTGA GCTGCTTGGC TTGACAAACG ACACTGTGAT TGATGTGTGG 60
TCAGTGTAAC CCAGGGTCAG AGGTCACGTC AGGGTCAGTC ACATGATCAG CCATGAATGA 120
TGATAAATTC ACATGTGAAT GAGAGAAAAG CAGTGAGAGC TGCTGATGTG AGCTGTGTTT 180
CTGAACAGAA CTGGTGTTTT GTGTGTGTGT GTGTTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 240
GTGTGGTTTT TTCGTCTGTG TTTGGGAGCT TAGAATCTAT TTCTAGAGTG GTTTCTGTGA 300
AACTAGCATG CTAAGCTGCT CATTTCAGCT CATTAAACCA CAGTGAGGCT GACGGGGTGT 360
TATCTCTAGA ATACACTGTA CAAAATGTCT GTTAACGAAC CGTTTCTCTA TTTTTCCTGT 420
CTTCCATTTA TTTGCGGTTG TGAGTTGCAT TATGGGATGT TGATCTCTGC TCGGTCGACT 480
TTTGATGTTG AAAATTCAAC CCCACAGTCT GACAAAGTGT CTTTTGTTGA CATTTTTAGT 540
AGTTTAAGAT ACTATAATGA ACAAGACATA ATCTATAGAT CAGTGGTCTC AAACTCCTGG 600
AGGACCACAG CTCTTTATAG TTTAGCTCCA ACCACCTCAA ACTCACACCT GCTTAATGTT 660
ACACTGTATA ACACAACATA CAACTTTATC AGATGAAATG AGTGTAGTGA ACTCATTGAC 720
TGAGGTTAAT TCTACTCATT TGAAAAGAGT TTTGAACCCT GTGTTGAAGG TAATGAGTTC 780
ATTTAAATTG AAGTAATGAG GTATTTAATT GAGTAAGTTT ACAGTACTCG TATAGATACG 840
TTTCTGGTAA CACTTTACAA TAAGTTTCAT TAGTTAATGC ATTTACTAAC ATGAACTAAT 900
CATGAACAAC ACTAGTACAA CATTTATTAA TCATATTTGA ACATTTACTA ATGCATTATT 960
AACATTCAAG TCCATGCTTG TTAACATTAG TTAATGCACC GTGAGTTAAC ATGAACTAAC 1020
AATGAACAAC TGTATTTTCA TTAACTAAAG TTTACTAACA TGAATTAATA CTGTAGTAAA 1080
TGTATTGTTC ATTGTTTGTT CATGTTAGTA AATGCATTAA TTAACATTAA CTAATGAACG 1140
TTATTGTAAA GTGTGACCAC ATTTCTTAAC TCAAATGGTT TTAT 1184