EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42415 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:60571344-60573414 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:60571865-60571882AATGATTAATTAAATCA-6.39
CTCFMA0139.1chr3:60572032-60572051GGGGGCCCCCTGGTGGCCA-6.93
CTCFMA0139.1chr3:60571796-60571815AAGCGCCACCTGGTGGCGG-7.24
CTCFLMA1102.1chr3:60572033-60572047GGGGCCCCCTGGTG-6.43
FOXB1MA0845.1chr3:60573100-60573111TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr3:60571897-60571908TAAGTAAATAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr3:60573100-60573111TATGTAAACAT+6.32
FOXC2MA0846.1chr3:60573100-60573112TATGTAAACATA+6.14
IRF7MA0772.1chr3:60571994-60572008ACTAAAACGAAAGT+6.18
KLF13MA0657.1chr3:60572438-60572456GTGCCACGCCTCCTTTTT+6.59
LMX1BMA0703.2chr3:60571870-60571881TTAATTAAATC-6.02
YY1MA0095.2chr3:60572143-60572155CAACATGGCTGC+6.14
ZNF384MA1125.1chr3:60572272-60572284AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:60572273-60572285AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:60572271-60572283TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:60572270-60572282TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr3:60572269-60572281TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAGCAAATAT CTATTTAAAT TAAAATCAAA TTAAATCAGG AAGCATTTTT TAGACATACT 60
CGCATATCAA TCAAATTACT AAATATGTAC AAAAATTGTT CAGTTTTCAG AAATAATTCT 120
AAATTAAGTG AATTTTTTTG TAAAACAAAT TAATCTGCCA ATGAGATAAG TAAAATAATC 180
TTATTTAAAA TCTAAAACAA TATTTTTATT TACCCTAATT GGCAGATTAT TGAGCTTTTT 240
TTAATGAAAA ATTCACATTA TTTTGACTAA ATATCCTTCT AGAAAATGCT TATTGGTTTA 300
AGAATTTTTA GATATTTGGA CTAAAAATCA CACAAAAACT ATAAGAAAGA AAATAAGCTT 360
TGCAGTGTAT TTAACAACTG TCAATTTTAT AAATCAGAAG CTTATTTTTT TAATCGCCAA 420
GTTCATAAAA AAAGCATTTT GCTGCTTACG GGAAGCGCCA CCTGGTGGCG GCTGGGTGTA 480
CTGTAGCTAA AGCGGTTATC TGCTGCAGTC AGTGTGAAAA AAATGATTAA TTAAATCAGA 540
TCTTTTGTAA ATTTAAGTAA ATATCTCGGC GCCTGAGTAT GTATTGCGGT CAGAAATAAC 600
ACTATAAATG GGCATATATT TTGTCCCACC ACTAATCCAC AACTCAACAA ACTAAAACGA 660
AAGTCACACA AGAATTTCAA GCACTCTTGG GGGCCCCCTG GTGGCCACGG GGCCCTAAGC 720
AGCCGCTTAG TTCGCTTATG CCTTAAGCCG GCTCTGCCAA GGGGTAAGAA AATTTCCCAG 780
AGTACACCAG TTACAGCAGC AACATGGCTG CAAACGGAAG TCAGGAGATC CACAAATTAT 840
TATTTTTTGT CATTATCATG AATTTTTACA ACAAACAAGC ATATGTTAAT ATATTCATGA 900
GCGCATTCGT GTTTTACCGG CATGCTTTAA AAAAAAAAAA ACGCATAAAT AAAACCAGCT 960
AAATTTGGCT AATCCCAACA CAACCTCACG GCAATTCGTA ACTTAGATTT AGTGGCTAAT 1020
TCGTATGAAT TCGTTCGATC TAATTCGTGC AATTTAGTAC GATTTGCTCA TCACCCAATG 1080
ACGGGTGGGG TTGGGTGCCA CGCCTCCTTT TTAAAATTGT ACATTTTCGT ACGACTGAAC 1140
TCGAATGAAT TCATACGAAT TAGCCACTAA ACTGACAAAG CCTAAAATAC TTACATTTCC 1200
TCGTGAGATC AGGCTGATAT GCCTAATAAT AACTCCTTTA GAGCAGTCCC ACAACAGTTT 1260
AGTGTCTGGG AATGAGCTCT TTACAGTGTC TGCTTTAATG TTAATGATGC TTTCATGTGT 1320
TTACATGATG AACAAGGCCA CTGTGTGAAT GCGCAGTATA GTTATGATCT TATTGACAAA 1380
TTAGATCGTT ATGATTACAT AATATATGCC TTCAGTGATT TCCTGAAGAT AAATACCAAA 1440
AAACAACACA ACTGGAATAA CTACAGGAGT CGCCAACGTC TGATCTCATA TGAAGCAAGA 1500
GATTGCGATG ACATGTGATG ATGTGTGCAG GTGCTGTAGT GCTGTCCCAA TTCTTATAGG 1560
TAAAGCCCTT CCCCTTCATG CTCTGTTTCA AGGGCCAAGG GGAAGGGGTA GGGGTACTAA 1620
AATAGAATTT TGAATGGGCC GTAGTCAAAG TATAGTTACT GATATCCATG TAAATGTACT 1680
GAAGGTCATC AGAAATCTCT GTTTGTACTC TTAATGTTTT GTCCTAATCG TTAAAAAAAT 1740
TCTGAGTATT GGCGTTTATG TAAACATATT CAATGTGAAG ACAAACACAG ACACACACAG 1800
AGACAGCAGC AGAGTGTGTG AGTGTAGTGA CTCCTGTAGG TGTCAGATGT GGAGAGTGTG 1860
TTGATGGACA TGAGCGCAGA GAGCTCCGAG TCTGCGGGAC AGAGTTCAGG TTCAGACGGC 1920
GCTGCGCTCA CAGATGCCTC ACAGATGCAG CAGCTCACCC TGCAGACCAC ACACATCAGG 1980
TACAGAAACG GGACCCCACA GCGGTCATGC ATGTATGGAG CACAATCTAT GCCAAAAGTA 2040
TTTGAAATCA AAGAAGCTTG TCGAATCGCA 2070