EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42389 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:60011880-60013066 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:60012744-60012755AAGAGGATTAA+6.14
HAND2MA1492.1chr3:60012697-60012707AACACCTGCA+6.02
Hmx1MA0896.1chr3:60012470-60012487AGAAGCAATTAAACAGA+6.21
Hmx2MA0897.1chr3:60012470-60012487AGAAGCAATTAAACAGA+6.25
Hmx3MA0898.1chr3:60012470-60012487AGAAGCAATTAAACAGA+6.31
TP53MA0106.3chr3:60012645-60012663AACATGTCTGTGCATGCC+6.92
TP53MA0106.3chr3:60012645-60012663AACATGTCTGTGCATGCC-7.09
TP73MA0861.1chr3:60012645-60012663AACATGTCTGTGCATGCC+6.4
Enhancer Sequence
ATGGTCCTCG TAAACCACCA AAACAATTAT CTGTGTGTCT TTAAAAATAC AGGCCAATCT 60
CCAGATGAAA AATATTGTAT TTTAGTATGT TATATGTACG TACTGTAGGT AACCACTCGT 120
TTGAAACAGT GTACAATAGC AGGTTGTATT TTTAACACAG CCATTAATAT ACATATTATT 180
TTGCAACAGC ATTTAAGCTA GTATACAGGG CATAACCCCG AACTGGCTGC GAAAATGAAT 240
TAATGGATGG CTGAATAAAT GCAAAGCCTG TTTGAATTTA GACTGCATGT TTTATAGCGG 300
GAAACAGCAA AGAAGGAGAT AGCAAATGGA AGACTTCATG GAGATAGACA GCTCTGAGAA 360
ACGATTTCTT GGTAGTGTTT TGTTGAATAA TAAAAAGATA CACAGGTTAT TGAAAAAAAA 420
TAGCACAACA TGGGGGATAT TTCACCAAAA TGGTTTAAAA CCTTTTAAAA GTGAGAGCGT 480
TTCTGTTTAT CATTTTTATA AGAGCAGCAT TTTGGTAGGA ATCAATGTTT GTGTGAGCCA 540
TTAATATAAT AATGATATAC GAGCTCATTG CTGCGAATTG AAGAAGTAAT AGAAGCAATT 600
AAACAGAGGA GCAACACTAG CCTGCTGTTT TTGAGCACAT TATTTTTGTG GACAGGAGTT 660
GAAAGAGGAT TTGTGCAGCT CAGAGACGAT GACTTCCTTC CAGCTGGATT ATCACTCAAA 720
TTTCTATCTA GAAAGCCCTC AGAGTTCAAC ACACAGCCCA TCAATAACAT GTCTGTGCAT 780
GCCTGCGGCG ATATAAACAA TTGCACCACC TCGACAGAAC ACCTGCAGGA GACAACCCTA 840
CCTTATCCAT TCTGTCTCAG CTCAAAGAGG ATTAAGATCA GAAGAGGATT CAACCTTTAG 900
TCAGATTGTA TAATAGTGAA TCAGTAACTG TCCACTGTGC TTGGTTTCGA TGCAGGAACC 960
CAATTTAGTT ACTGCGCACT TCAAATATAT ACTTTATTGG TGATGGGATA GCACATGCGT 1020
TTTTAAAATT GCTTCAAGTG TTCACAGTTA GCTGATGATG GATTAAAAAG CTTGTTTGGC 1080
ATACTGTCCC GGGGGAGAGC CCTAAGCTCA AAAGATCCTT GAGCCCGGGG GTCCCTCCCA 1140
TATGCAAGGT GAGAGGGGAG TTTGAGCTTG AGAACTCCCC TGCTGT 1186