EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42305 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:57471649-57472657 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HAND2MA1492.1chr3:57471934-57471944TGCAGGTGTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr3:57472205-57472218TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr3:57472194-57472207TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr3:57472197-57472210TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:57472201-57472214TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:57472198-57472211AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr3:57472202-57472215AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:57472195-57472205ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472199-57472209ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472203-57472213ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472207-57472217ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472195-57472205ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472199-57472209ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472203-57472213ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:57472207-57472217ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AGCAGCTCAA TCATTAATAA ACCCAATATC GACTGCACAA CACCGCTGCT AACTGTAAAA 60
AAATATATTG TTTTTCCATC TTTTGAGATT CACAGATTTT TGTCATTTAT TTACGCTTTT 120
GAATTGCGTC ATGGGACAGC TATTCCTCCA AGACTTTACG CTAAATCCGT TTGAAACGGC 180
GACTTTTATT GACATTTTTT AGATTTGTTT GAAGTAATAT ATTGTCTGTA TTGGTGTTGT 240
AAATTATGGC ACAATCACAG TAAAAAACTT TCTAGTTTTG TGATTTGCAG GTGTTTTTTC 300
TGTTTGTTTA CAGTTGTGAA TTACATTATA GGACCTCAAT CTCTGTTTCA TATATATATA 360
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 420
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGTGTGTG TGTGTAGTTG AAGTCAGAAT TAATAGCCCC TCTGATTATT TACTTATTAT 540
CTGATTATTA ATTAATTAAT TAATTAATAA TTGTTTAAAA TGATTAACAG AATGCTTGTT 600
CTCTTGCATT GAAAAGTAAA ATAGTGCCAA GTTTAATTTC ATGCTGACTT TAAGGACAAT 660
TTAATGTAAT TTTATAACAC TTATTTAGTA AATAATTAAA TTTTAATGCA ATTCTAATTA 720
ATTTTGTAGT AGTATTTAGG AATTAGTCAT TTATTAACAT AACACTTGAC CAAACACATG 780
ATGAGCAGAG TCTAGTTGAG GGGAAACGCA TTGAGTGACC TCTGCTGGCT CTGAGCTCTC 840
ACTGCACAAC ACACAATAAT ATAATAACAC CGAATTCATG CCTCTTCAGG AAATACATCA 900
CAACAAACGA CAACAAAATG AGTGCACTTT ATTTCAAATC CTGCAAATCA AATTATAGTT 960
CTGAACATAA AATAAAACCA ATAAGTCTGT CCTAAATTTG TATACCAA 1008