EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42303 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:57454593-57456413 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:57456041-57456053AAACAAACAAAC-6.32
GBX2MA0890.1chr3:57454737-57454747ACCAATTAGC+6.02
GBX2MA0890.1chr3:57454888-57454898ACCAATTAGC+6.02
GRHL2MA1105.1chr3:57455444-57455459AACAAACCAGTTTTC+6.7
Enhancer Sequence
AGAGGTCAGC GTTCAAAATT TTAGCATTCA GTATTATAAT ATTTAACGTA CAGCATTTTA 60
GAGTTCAGCA TTCAGTATTT AACGTTCAGC ATTTCAGAGT TAAGCGGTTA GTATTTAACG 120
TTCAGCATTT CAGCATTAGC ATTTACCAAT TAGCATTTTA GAGTTCAGCA ATCAAAATTT 180
CAGCATTCAG TATTTCAATA TTTAACGTTC AGCATTTTAG AGTTCAGCAT TCAGTATTTA 240
ACGTTCAGCA TTTCAGAGTT AAGCGTTCAG TATTTAATGT TCAGCATTAG CATTTACCAA 300
TTAGCATTTC AGAGGTCAGC GTTCAAAATT TTAGCATTCA GTATTTTAAT ATTTAACGTT 360
CAGCATTTTA GAGTTCAGCA TTTAATGTTC AGCATTTCAG AGTTCAGCTT CCAGTATTTA 420
ACATTCAGCA TTTCAGAGTT CAGCTTCCAG TATTTAACAT TCAGCATTTA ACGTTCAGCA 480
CTTCACTGTT CAGCATGGCA GTGTAAGGCT GCTCAGCATT TCACCGGTCA GCATGGCAGT 540
GTTCAGCATT CAGCGTTCCC ACAGTAAGCA CCCATCCCCC ACAGTGAAGT CAGACAGCTG 600
AGACACATTC CTCACCATCA GCCAACAAGT GCCACAAACA CACACATTAT AATGCCACAG 660
CGAAACATTC AGAAAACACA ATGCTCAATG TGTTGAGTGG TGTGCACGAT ATAACCTGAA 720
TGTGTGGTTT CTTGCTGAGA ATGCGAGACT GAGTTTGGAC AAGCTGCAGC CTGTAGAAAT 780
CGCACTAGCA GGAATTGAAC AGACTCACTT CACAGGTATA TGTGCAAAAG TTAATGAGCG 840
ATAAAAGTGA GAACAAACCA GTTTTCAGGG TTTTTTTCGA ACTTTGTCAT AGCAATAATC 900
ACATACAAGA GGATGAGTGG CGTGGAAAAC ATTTTAAGAT GGAAAAACAA ACAACCAACC 960
AACCAAATAA CAAAACAGCT TGAGCACATG CATTATTAAG AGGATCACAG AACAATAAAA 1020
CATTCATCCA TCAGCAAAAT CAACGAGGCC TTTCAACACA ATGATTAATT CATAACTGCC 1080
TAAACAACAA AGACAGTTCA CATGAAAAGG TACTGTTGAC ATTAGAGAGG CAGCAGTCTG 1140
ACAGCATCAT CACACTTGTT CTATACAATA TACAGCTCTG GAAAACATTT AAAACATGTG 1200
TTTTGAGTGA AATGTTGTGT TAAAACTAGA GGTGTGAACC TATACTGGTC TCACGGTTCG 1260
GTTCGGTTAC GATTATCATG CCTTCGATTC AATTCAAAAC GATATCTCGG TGCATTGACG 1320
ATGCTTTCCA TATACAGTGT TATATTTTGG GGGGAAGGTT ATAACAAGCT GTCTGTATAA 1380
ACACACAGAG ACACAGCACC ACACTATCTC TCATTCAAAC ACATACACAA ACATAGTCGG 1440
CACCAAAGAA ACAAACAAAC ACACACACAC ACGCGTGCGC ACGCACGCAC ACACTTAAGC 1500
CCTTACAACA GGGAGAGCTC GCGATGAGCG GAGCAGAAAA ACGAAAAAAA CTGGAAAAAA 1560
AAAAGAAGCA CTTTTCCGAC GGTCCCTTAC CGAGAGCTCC TCTCAGCGCG AGCTCTCCCG 1620
GCTAAACAAA TATTGCGAGG GCTTAAACGG AGAAGTGGTC GTAATGTTGA GCGAAAAAAA 1680
AGAAAGACAG CTGTGAAACA TAACCAGCTT TGCCTTTTTG TAGGAAACAC ACTTTTTTCT 1740
TTTTAGGGTA AGAGGTTTTT GAGTTATTGC CGTCTACAAC TGAATGTGTG TCAGGAATAT 1800
CGAAAACAAA ACCAACTGAA 1820