EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42287 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:57058153-57059101 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr3:57059040-57059057AAGGTAAGCTTGACCTT-6.05
FOXE1MA1487.1chr3:57059073-57059088TCCTAAACAAACAGT+6.32
HNF4GMA0484.1chr3:57059050-57059065TGACCTTTGACCTCT-7.22
NR2C2MA0504.1chr3:57059050-57059065TGACCTTTGACCTCT-8.25
Nr2f6MA0677.1chr3:57059050-57059064TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr3:57059050-57059064TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr3:57059050-57059064TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr3:57059050-57059064TGACCTTTGACCTC-8.12
ZNF263MA0528.1chr3:57058621-57058642CCCTCCTCCACCCCTTCATCC-6.59
Enhancer Sequence
GGCTGTACAT CCTTTACCAA ACCAAACCAA CACTAATTCC CAATCTTACA GGGATTGCTC 60
ACACTCCGGA CCCCCAACCA TTCCCTCACC TCTGGCTGGG AAAACCATGG CTCAGCACGC 120
AGGTGGAGGA GGACATGGAA GCTGCTCTAT GCAGCGAGAT GGACAGAAAG TTGCCCGTAT 180
TCGTCACCAA CAGCACAGCA GGGCGGGCCC GGACACCCCA GGTACAGACA TGGCGCAGGC 240
TAATGGTAAC CAGGAGATGA AGCAGAAGAT GGAAATGTCC CCTTATGGCT ACAACAACAA 300
TGCACAGCAT CACCCACATC AGCAGCCATC AGTGCCACCT TGGGCCATGC AGCCTCATCA 360
CATCCACTCT GAAGAAAATC AGCACAAAGC TTATATGGAA CCAAACAGTG GAGCTGCCAA 420
TAACAGACCG CCCACACAGC AGCAGCACCA AACAACAGGA ATGGGTCCCC CTCCTCCACC 480
CCTTCATCCA GCTCCTCCTC AAAACCAGCA GGAGGTCTCA GGCTCACAGG GAGAGAATAG 540
TGCCATGAAG AACCTTCTGA AGTACAGCAA CCAGCAGTCT CTCCCCCTGT CACAGAAAAG 600
CCCATTTGGA GGACTTGGGA GTCTTAAAAC CGGGCCAAAT GGCACCAGCT GCTCTCTTCA 660
GGGAGGCAAG CAGACCCTAC CTACCAGGAA AGGCCAAAGC CATGAAAATG AGCGAGGTGA 720
TTGTGGGGGA CGGGGCCGAG AGATGGGAGA GGCCCAACAT CTAGAGGGGG AGGTTCGACA 780
GCCTCCAGTA GGGATTGCAG TTGCTGTGGC AAGACAGAGA GATCCTCCAT GCCAAGCATC 840
AGGCAGTCAT CCCAGCAGCC GACAGGGGCG GGTGCACTCC ACCATGAAAG GTAAGCTTGA 900
CCTTTGACCT CTTAAATCCC TCCTAAACAA ACAGTGGGCA GGGAGACA 948