EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42249 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:55935187-55937497 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:55937410-55937421ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr3:55937410-55937421ATATTTACATA-6.62
FOXC2MA0846.1chr3:55936156-55936168TAAGTAAATAAA+6.07
ZNF24MA1124.1chr3:55936133-55936146TAATGAATGAATG-7.12
ZNF24MA1124.1chr3:55936141-55936154GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr3:55936137-55936150GAATGAATGAATG-7.82
ZNF384MA1125.1chr3:55936092-55936104TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr3:55936095-55936107AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr3:55936097-55936109AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr3:55936101-55936113AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:55936094-55936106TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GAGGAGCGAG GAGCAGATGG TGCTCTCGGG CCTGTTGCGA TTACACAACG CGCTGGTTAA 60
AGCGTAAGAG TGCTCAGCCG ACGGCAGCCA AGTCAAGCTG CTAAAAATAC AGCGCTGTAA 120
TGTTGAGCTC AGCATGGCGC TAAAACAGCC AAAGGTTAGC GACGAGGTGT GCAGTTTAAA 180
TGGGTGAACT GTGAACAATC TGGGGTTTCC GCTAATAATT GCTAATGTGC TGAAGAAGAA 240
AAGGCCTCAG TTGGGTAACT AATAGTCTAC TCAAATAGGT AATACCAAAG TATACACAAG 300
ACATGTTACT CGTATCTTTT TGGAAAAGTT TAACTGTCAA TATGGTGAAA AAAGCCCTGC 360
ATACTAGCAC AGGAGCCAAT CGTCAATTGC TATATACCAG GGGTGTCCAA ACTCGATTCT 420
AGAGGGCCGG TGTCCTGCAT AGTTTAGCTA CGACTTCCTT CAACACACCT GCCTGGAAGT 480
TTCTAGTACA CCTAGAAAGA GTCTGATTAG CTGGTTCAGG TGTGTTTAGT TGGACACCTG 540
CCCTCCAGGA TCGAGTTTGG GCAGTCCCGC TATAGACTGA TGATACTCTG GGGGAGGGAC 600
TTGGACCAGA TGTGAGTTTC TGCAGATTTT GTGTTATTTG GATGTTTAGA AATGAAACTA 660
AAGAGACAGT TGTTTAATTT TACTGGTGAT TCCTAATATG AAATTCAATC GTAAGCTTGG 720
CAAGCAGTTT TGGAGAATTT GATGTTTCCC CATTCAAACA GAATGCCCGA GCGGCGTTTC 780
AAAGATGGCC GCCAAGTGAA ATGACTTGCC TTAAAGGGAT TTTGGTGATA CACTGTATAC 840
CATCATATTA ATGCAAAATG ATATGTAAAC TATAATGAAA AGTTTTGGCA ATGGAAGATT 900
AATTATGTAA AAAAAAAAAA AAAAAAGAGT CTGAACAAAA TCCAAATAAT GAATGAATGA 960
ATGAATAAGT AAGTAAATAA ATAAATCGTC ATGTTAGAAT TATCAGGTTT TATCTGACAT 1020
TTTGCATATT CGTATAAAAT GACAACTTAT TTACAATACA TGATGTTTTT TTTAAACAAG 1080
TTGTTTACAT TTTTAGACAT TTATTTTAAA AACTAAAAGG TTTTATCTAC AAAGTCTACC 1140
TCTAGCTTGG CTCTATCCGC TTGTTAAGTG GTGACATGTT GGTGACGTAT GTATACTGTT 1200
TCCGGGTCCA AGCCACCATT CATTTGAGTT GGGAAACTAT TTGTTTATAA TCACTTTTAA 1260
AATTACACAT TAAAATTAAT TTTATATAAA GTCATAGTGT ACACAACAAT CCCTGGGCTT 1320
GCTGCATCAC AAATATCAAA ATTTTAACAA TTTATAAAAA AATTAATCAC TTTCTGGCCA 1380
TCGGATATTA GGCATGGAGA TATATACTGC AATCAGGATT TTCGAAAGTA TTAAATCGCT 1440
TTGTAAACGT TTATAATTAC CATTTCATGA GTCTCCCCAT ACAGTTGAAT AGAGCGCTTG 1500
GACCCGGAAG CCGCTTCGCG TGACGTCACA CTTGACTTTA ACAAGCGGAT AAGGTTCTTT 1560
CTGTGAGCCA ATCAGCATTT CAAATGCACG CACAAGGGAT CATGATCAGA ATCAGGATCT 1620
GCTTTCTTTG TCATTCTGCC GGATTGCTCC GTTTACAGCG GCTAGTCGAC TAAATAATCT 1680
CCACGCAAAA TTGAGAAGAA ACCTGAAACT GAAAAGGTGT ATGTCAAAAG CTGTCTTATT 1740
TTAGAGGCTG CATCCTCCGA AATATATTTT TTCCCAGAGA TGGGTTGCGG CTGAAAAGGG 1800
CATCCGCTGC GTAAAACATG TGCTAGATAA GTTGGCGGTT CATTCTGCTG TGGTGACCCC 1860
AGATTAATAA AGGGACTAAG CCGAAAAGAA AATAAATAAA TGAAATATAT TTCTATTTGT 1920
GTGTTTATAG ACTGTAAATA TGTAAACAAC TCATTTGCTT AATGTCTGTT TTCTTTTAAA 1980
GTCTTTAAAC TTGACATTAG GCCTTGAAGT TTAATTTATG ATTATTATTC TGTCCAATTA 2040
CTTTGGACCC TTAACAAGTG GGAAGCATGT ATGCAAACTG TTGCAATTCC TGCAGCGTTC 2100
ACCTGATTTG AATGTTAACA TCCTCAATTT AAATCACATC TTGTTCACTT CACTTCAAAT 2160
CCATTGTGTT GGCCAAAAAT GTTAGAATGG TGTCGATGTC CCAATATTTA TGGACCTAAC 2220
TGTATATTTA CATAACACAG CACTAGTAAG CATTAAATAT AGCCACCAAA TGATAAAAAT 2280
GTTTTACTGT AAAGTTTGCC GAAGGCTGAT 2310