EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42235 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:55587902-55588997 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF3MA1482.1chr3:55588075-55588089GCTCCCTGGGGAAA-6.61
RARAMA0729.1chr3:55588944-55588962AATTGAACATTTGAACTT-6.28
RargMA0859.1chr3:55588946-55588962TTGAACATTTGAACTT-6.14
Enhancer Sequence
AAGCGAGGGG TGGGGGAGAG ATTGAAAACA TTGAAACGTC ACAGAAAGGG CTGCTGGGTG 60
CCGGGCTCTT AAAGCGCCAG CGCTGAATGG CTGCTGTCAC TGGGCAGATG TGATTAGCGC 120
CCCCTCCTAG AGCGCCAGCG CTGAGGTCAT GGAGCGGTAG GCAAATGAAG GAGGCTCCCT 180
GGGGAAACTA GCGGTACTGG AGAAGAGGGA CGCTTGGCAG TGCTCAGTAG GGGTCCTGCT 240
TCAAGAAAGA AGAGTGGCGG AAAATATATT CTATTATACA CAGTGCTGAT GATCCAAAAA 300
GGACCATCTA TTTGTCTGCA TAGGAGAAAG AAGAAAAGCA TATGATTGTC AAGTTGATGT 360
GGACAGCCAG AATCCAAGGC AGCCGACAAG AGTTGTGAGT GGGATGGCGT TAATGTCTTG 420
ACTTCCTACT CACTTTGACC TCAGACATGA GCTCAGTGTC AGCAAAGCGA GCCTGCGTGA 480
CGTCAAATGG TGAAGAGGTC AAACAGAATC GTCACTTCTA TAGAAATGCA CTCTTTTAAA 540
GTCCCATTGA TGGGAATCCT GGGGAATGTC TCTTTGTGTC CGCATGAATA GCTGAAAGTG 600
ACCCTCTGAC CACAGTTCAC CCATTAAACC AACACTAAAC ATCGCAGCTC AGTCCTTCCA 660
GTATGTAACA TGAAGGGTCA ATCCTTTAGC GCTTTAGGAA TGTAAGTTAG GCTACCATCT 720
TTAATCCAAA TGTCATTTTT CTTGACTTTC ACTGACTAAA AAGCTGAATT TCCATGACCT 780
ATAATGAATA CGAAAACAGC AGAATTCTGA GATTCTCCGA TCTAAATTAA ACACAAAATC 840
AAGCAAACGG CGCAAAATTT AAGAGCTTCC AATTTCTATT CTTGAAGATT TCACACAGAT 900
TTTGGCCAGC CAGTACACTG TTTAAATTCC TGCTCTGCCA TCTGCATAGT TTCATATCAA 960
ATATCATTAT AATCACACAT AGAAAGTGTT CGATACCTCA AGTTAGGGCT GAGCAATTTG 1020
ACCTAAAATC TAAATTTCGA TTAATTGAAC ATTTGAACTT ACGATTAATG AATAATACTT 1080
TCATTTATTT AATTT 1095