EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42185 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:54736292-54737326 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr3:54737094-54737107CTAAAGTAAACAT+6.42
HLTFMA0109.1chr3:54736388-54736398AACCTTATAT+6.02
Lhx3MA0135.1chr3:54736293-54736306AGCTAATTAATTA-6.09
Lhx3MA0135.1chr3:54736296-54736309TAATTAATTATTT+6.71
PAX6MA0069.1chr3:54736621-54736635TTTACGCTTGAGTG+6.83
POU4F1MA0790.1chr3:54736297-54736311AATTAATTATTTAA-6.01
POU4F2MA0683.1chr3:54736295-54736311CTAATTAATTATTTAA-6.76
POU4F3MA0791.1chr3:54736295-54736311CTAATTAATTATTTAA-6.61
ZNF384MA1125.1chr3:54736306-54736318TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAGCTAATTA ATTATTTAAA AAAAAACATA TAATAATGGA TTTTTATAAA ACCTCTAGTA 60
AAAAAAAAAC ATATTTATTA ATAGATCCAA CTCTTAAACC TTATATGCTT TTTCTAGCAT 120
TTTTTGTAAG ATTTTTCATT TTCGATATTC ATGCTTAAAT GATTTTCACT GGTGATGAGC 180
TAAGTGAATG TTAAAAATGA CTACCTGGTA GTCAAGGCGC TTAATGAAAA ACAGAAGTAC 240
CCCGGTACAC AAGGTGGCAC TGCTCAATTA GACTAGCAGC TCCGCATTCA TCTTCTTCAC 300
CTTTAGAAAT TTGTGTTGGG ATAGACCATT TTACGCTTGA GTGCCACTAA TTCATGTTTT 360
ACGTTAACTT CAGAAGCTCA TTGTATGTGA ACAAATGCAC CAATCTCATT GGTGGGTCAG 420
TTTTTAATGT GATGCATCAA ACCAAAAAAA AATAGTCTAT GACAGTGGTT CTTAAACTTC 480
TTTCACCAAG TACCACCTCA GAAAAAATTT TCTCTCCAAG TACCACCATA ATCACCGGTA 540
TTAAAACCAA GTAGCGTAGT TGGCCAAAAT AAGCAGCTAC ACCACTGCAC AGTTCGAAAA 600
TGAGGAAGAG TCATATTGAT TTAACGAAAT TATATTCCAT ACAAAACATG ACGCCGGTCA 660
TTCTGAAAAG TCGGCATTCA GAAAAGTTAG GATGTTATAA ACTGGATACA CCTGGAATAC 720
ACAAGCGCGT CATGCTGCAG TACTCATTTT CTCTAGTTCT GTGCCAATTA AATTGATTTT 780
TAGCAGCTGA TTACGCGATG TACTAAAGTA AACATTTTAT GCGTTGTTGG AGTTATTGTA 840
CGAATCAAAC TCATTACTCA GTGATTCCTC TGCGTACCAC TAGAAGTAAG CCTGCGCACC 900
ACTAGTGGTA CATGTACCGC AGTTTGAGCA AAAAAATAGA GAAAGGAGTT GAACACTTTT 960
ATTATATCCA TCAAATGATA ATAATAAACC AACATCAACC TCTTAATTGA AATTGATAAA 1020
TCAATTAAAA AGTT 1034