EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-42107 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:53294159-53295317 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6MA0677.1chr3:53294224-53294238GAGGTCAAATGTCA+6.41
RREB1MA0073.1chr3:53294496-53294516CCACCAATCACCCCCTACCC+7.51
RXRBMA0855.1chr3:53294224-53294238GAGGTCAAATGTCA+6.35
RXRGMA0856.1chr3:53294224-53294238GAGGTCAAATGTCA+6.11
RxraMA0512.2chr3:53294224-53294238GAGGTCAAATGTCA+6.22
Enhancer Sequence
TCCTCCATCT CCAGAAGCCC CCATTGCTGC ACACTGCTTT TCCTTATGAA CCCTTCACAT 60
GCTGAGAGGT CAAATGTCAG AGGTCAGCAG TCTGATTGTG ATGATAATGT CAGCCAGTGT 120
AGTGTGTGTG TGTTGGGGAG GGGCTTCGGG GGGCGTCTGT TAGGGAGAGA ATGTCTTTCG 180
GTGAGTGGGA TGGGGGAAGA GTCCGGTACG GAGAGTCATG TCATGTCATA TTTCCTGTAA 240
TCCCTGGTCT TCTGCTCTGA AAACATTCGC ACTCTTTCTG AATCCCAGAT CCCTGTTGCT 300
GCGGCAACCT CACAGACGAC CGAGCAAGCC TGACACCCCA CCAATCACCC CCTACCCTTC 360
ATCCCCTTGG CTATTTGTCA TGGCTTGGCT GGGTTTATTT AGAGGCAAAT TAACTATGTC 420
TGGAATCTTT AGGGTCACTG AAAAAAAAAT TAACTGGGAG TTGCGGCAAT TTAAAGAGTT 480
TTGAGGAGAC AGGGAGGAGA CCTGCATCAA GGTTCAACTA GCATGCAGTC TGACACTCAA 540
ACCCCTTATA AAAGTGCACA TTCTCGGCAA TGGGCCTTTA AACACCAGAG ACGTAGATTA 600
CTTTACAATT TGTTGTTTGC CTGTCTTTGA CTTTAGGAAA CAATGTAAAT GCCAGAGAGA 660
GTGAATGTGT ACTAAACTGC TCAGATTCTG GGGTAACCAG AACTATGTAA CAAAAACAAA 720
CCTTTATAGT TCACAAACAG TTAAAAGTTG TTTTGATGGA CCTCAATGGT CTGCTGAATC 780
ACTGCTGAAC TGCTTGTGGG ATTTTAAACT TACTCGACTA TGAGGAATTG TGGATGTGTT 840
GACAAGAACT ATTTCCAAAC ACAAAGAAAG GGAGCCTCTG GCCTGCAAAA CATGATAACG 900
TGCATGTGTA TGAGTTTTGG AATGCACTCC ACCTCTTTCT CACTCTCTCT CTCTCTCTCT 960
CTCTCTCTCT CTCTATCTGT GTATCCATGC TGGAGCGTCT TACTTATTGC ATCATGAAAA 1020
CCTTGGTTAA AGTGTGTGTG AATGTGTAGA AATTGGTCAA GTAGCAGCAG GGGGGGTTAA 1080
AATATTTGTC CTCGCAGTGT TCTGTAGCCA AAACACACAT TCTTTTGTCT GGGTCTTGGC 1140
TGTGCCTATC CAAAAACA 1158