EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41989 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:49923195-49924435 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:49923298-49923317GGGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.64
CTCFLMA1102.1chr3:49923299-49923313GGCGCCCCCTGCTG-7.31
ELK4MA0076.2chr3:49923325-49923336CCACTTCCGGC+6.62
NR2C2MA0504.1chr3:49923937-49923952TGACCCCTGACCCCT-7.2
RXRBMA0855.1chr3:49923937-49923951TGACCCCTGACCCC-6.04
RXRGMA0856.1chr3:49923937-49923951TGACCCCTGACCCC-6.1
SOX21MA0866.1chr3:49924383-49924398AACCCTGTCATTGTT-6.3
ZNF384MA1125.1chr3:49924281-49924293GATAAAAAAAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr3:49924284-49924296AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:49924285-49924297AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:49924286-49924298AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:49924287-49924299AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:49924288-49924300AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:49924282-49924294ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:49924283-49924295TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
CGGGACCTCG GTTTAACGTC TCATCCGAAA GACGGCGCTC ACTGAGCAGT ATAGCGTCCC 60
CGTCACTATA CTGGGGCATT AGGACCCACA CAGACCGCAG GTTGGGCGCC CCCTGCTGGC 120
CTCACTAACA CCACTTCCGG CAGCAACCTA GCTTTCCCAT GTGGTCTCCC ATCCAGGTAC 180
TGACCGGGCG CAGCAGTGCT TAGCTTCAGT GGGCGACCAT GTGAGAGTTG CAGAGAGCTA 240
GCTGCCGGTA CATACATTTA TCTGCCCATG ATCTATTTTC ATATCAGGCT GATAACTATA 300
ATAATAAAAT ATACCAATAC CAATATGGCC ATCAATTTAT TGTGCATATG CATCCTGTTT 360
ATGCTCTAAT CTTTTAAAAA TTATAAACTA TAATTTCACA TGTCTAAAAC CCCCACGAAA 420
GCCTATTAGC ACATATTGTG CTAAAGGCTA ATGTCCTTCA GCTAATACTG TAGTTGTCCA 480
TGTTGATCTC TGGAGCGGTT TATCTAATGC TTGCATTGGA GAGGATCTGT ATTTATAGCT 540
ATGTGTGATT ATGGCGTATG AACAGGGAGC ATGGGAAGGC AGCGTGGGAA ACCGCAGGCC 600
TCTGAAGGGG TGAGTGACTC TCCAAATACC CTCTGTTAGA GTCTATGATA GAGACACAGT 660
TCGGCTGGAC TTCCTCTGTA CAGACTAAAC ACATCTCCCA CTATTTGCTC GTCTTTCTCT 720
ATCGCCGCGA CCCTATACAT ACTGACCCCT GACCCCTGTG TGAGTTTAAG AGGTTCAGCA 780
AATCTCATAG AATAACATAC ACGCTTTGGA CACACACATC ATGCATATGA GGGCGGCTGC 840
GGTTTCCAGC TACATGTTTA TATATTCAGT CATAATTCAG ATATTGTTGG AATTTTATCT 900
TCATTTGTCT GTAATATGGA ATGATTGTAT GTACAAAAGT GGCAAATTCT GACTTAAAGT 960
TTTTGTTCAG TTCATATATA TATATATATA TATATATATA TATATACATA CAGTTGAAGT 1020
CAGAATTATT AGCCCCCATG AATTATTAGC CCCGATTTAT TTTTCCTCTA ATTTCTTTTT 1080
AACTAAGATA AAAAAAAAAA AAAAATTCAA CACATTTCTA AACATAATAG TTTTGTCATT 1140
CATTTAGTTC TCAGCTTTTT TTCTTTAAAA ACACTTTACA AATGTACAAA CCCTGTCATT 1200
GTTCTTGTCC TCAGCTAGGT TAAATGTACA GCTTTAATAG 1240