EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41984 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:49833004-49834030 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr3:49833011-49833025TTAATATTGCAAAA+6.1
HNF1AMA0046.2chr3:49833043-49833058CATAAATCATTAACA+6.53
HNF1BMA0153.2chr3:49833044-49833057ATAAATCATTAAC-6.3
STAT1MA0137.3chr3:49833293-49833304TTTCTAGGAAA+6.14
Enhancer Sequence
TGGTTTGTTA ATATTGCAAA ACTGAATTTA GGAATGAAAC ATAAATCATT AACAAAGTAT 60
GAAAATACAA TTATTAAGCA CATACAGTTA AGAATAATGT CAAGAATACA GCATTTGTAG 120
CTGTAGTTAT AAATTGCTAC AAACGTTTAT TAATGTAGAG TTAATGCTTA ACAGATGATT 180
ATTTCACAAT TTGCGAATGC TTAATAAATG GTTAATAGTG TGTAGTCATC AAAGTAACTC 240
ATCCAATCAC TGTAGGCCTG ATCTCCATTT GAAGAGAGCT TCTTACAGGT TTCTAGGAAA 300
AAGGCTTTCA AATTGGGGTT CGAAAGGAGG CGATAAAAGG TCCATGTGAT ATTTACACAT 360
TGCTAACTAT GGTGTGCTTT GGCAGTATCC CTGGTTCACA AAATCAGTCT TAATTTGCAC 420
AGATACATTT TTGAAAAGGT GCAGCAGGGT GGTGCAGCGG GTATTGCTGT CGCTGGTTCA 480
AGCCCCAGCT GAGTCAGTTG GCATTTTTGT GTGGAGTTTG CATGTTCCGC CCATGTTCTT 540
CTCCAGTGTT TTCCACCACT GCCCAAAGAC ATCTGCTATA GATGAACTGG GTAAGCTAAA 600
TTGTCTGTAG TGTATGTGTG TATGTCCTGA TCCTCCAGTT CCAGGTTGGA AGTTGGGCAT 660
CTGCTAACAA CACACCTTGT AAAATAAGTC AAATTTTGAA ATAGTCCAAA CTTTCTTTTT 720
TATGTCATTA GAGTAATAAG TAATGGGTAT GTTCCATGAA GACATTTAGT AAATTTGTTA 780
TTTATGCATT GCTATAATTG CTAAGATTTA ATCAACTCTA AAGGTACTTT AAAGACGATT 840
TTCTTGGTTT TTAGATTTTT TATTTATTTA TTTTTTTGTA ACATCAGATT TCAGACATCC 900
AAGTAGTTGG TTTTCAAGTA TCCTGGCCAA ATATTGCCTT ATTTATAGAT CCCAACAGAA 960
CATGGATGGA TTGAGCTACA TATCTCTTGT ATGTTGTACA CATTTGTACA ATCTGCTAAA 1020
GCCCCA 1026