EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41948 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:48707205-48708813 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:48708414-48708424ATCACGTGAC+6.02
CUX1MA0754.1chr3:48708759-48708769TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr3:48708759-48708769TTATCGATTA-6.02
HNF1AMA0046.2chr3:48708650-48708665GGTTAATGATTAAAA-6.03
HNF1AMA0046.2chr3:48708650-48708665GGTTAATGATTAAAA+6.46
HNF1BMA0153.2chr3:48708651-48708664GTTAATGATTAAA-6.07
HNF1BMA0153.2chr3:48708651-48708664GTTAATGATTAAA+6.48
ONECUT1MA0679.1chr3:48708758-48708772ATTATCGATTATTA-6.17
ONECUT2MA0756.1chr3:48708758-48708772ATTATCGATTATTA-6.32
ONECUT3MA0757.1chr3:48708758-48708772ATTATCGATTATTA-6.05
PBX3MA1114.1chr3:48707538-48707555ATATGAGTGACAGGTTG+6.7
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:48708414-48708424ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:48708414-48708424ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr3:48708414-48708424ATCACGTGAC+6.02
ZNF24MA1124.1chr3:48707390-48707403AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr3:48707394-48707407GAATGAATGAATA-7.52
Enhancer Sequence
AATAATTTTA ATGCTACTGC TACTAATAAT AATGATTATA GAATTAAATT ATCAGTTACT 60
TCAGTAGTAC TGCAGTACTG GGTTGTGGCT TATAGGGCAT CCATTGCATA AACAAGTATG 120
CTGGATAAGT TACGGTTCAT TCCACTGTGG TGACCCCTGA TTAATAAAGG GACTACGCAG 180
AAGGAAAATG AATGAATGAA TAATCATTTG ATTAAGCACT TTTCCAGTTT GTTGAATGAA 240
ATAATAAACA TACATTTTAC ATTTGTGGCT GGTAAATTTT GTCTAGTCAC TGGCCTTTGG 300
TAGGTGTGGC AAAATGTTAC CTTTAGCCTA TGCATATGAG TGACAGGTTG TATCAGCAAA 360
ATTACAGACA TACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 420
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CGCACACACA CACACGCACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACACATA CACACATACA CACACATTGC AAATAAGTAG TTTGCTTAAA 540
ATGATATTAG CAAATTTTTT TGCATACATT TCGTTGTTCT GGTGTTTATT TAAATGTACA 600
CTAACTGGGC ACTTTATTAG GTAATGCGTT TAGGCAAGTG GACATGGTAA AGATGATCTG 660
CTGCAGTTCA AACCGAGCAT CAGAATGGGG AAAAAAGGTG ATTTAGGAGA CTTTGAACTT 720
GGCATGGTTA TTGGTGCCAG ACGAGCTGGT CTGAGTTTTT TAGAAACTGC TGATTTACTG 780
GAATTTTCAC GCACAACCAT CTCTAGGGTT TACAGAGAAT GGTCTGAAAA AGAAAAAATA 840
TCCAGTGAGC GGCAGTTCTG TGGACACAAA TGCCTTGTTG ATGCCAGAGG TTAGAGGAGA 900
ATGGCCAGAC TGGTTCCAGC TGATAGAAAG GCTACAGTAA CTCATATCAT CACTCGTTAC 960
AACCGAGGTA TGCAGAGCAT CTTTGAACGC ACAACACGTC CAACCTTGAG GCAGATGGCC 1020
TACTGCAGCA GAAGATCACA CCGGGTGCCA CTCCTGTCAG CTAAGAACAG GAAACTTAGG 1080
CCCCGTTTAC ACTAGTACGT TTTAGTTTTA AAACGGCGTT TTAGAATGAA AACGATCCGC 1140
GTCCACACTC GCGTTTTACC CAGCGTTTCT GAACTGCTCT CCGTCCACAC CAAAACGCTG 1200
AAAACGCACA TCACGTGACC ACACAGACAC TCTCGGGCAA GCACTGCAGC CCATCTACCC 1260
GGATGAGAGC TGTGCTAGTC GAACTTCTCA TCAAGCATCT CCCGCTGGAT CTAATCTCAC 1320
TATATTTATT AAACGGGATA TTTCATTCAT CTTGTTGTCT TTATCTAACG ACATATTCCC 1380
TGACTTTGGT CAATGGAATC TATTACTTTT TCTCAGGTAA CGTGTTTTGG CTAAGCGCAA 1440
AGATAGGTTA ATGATTAAAA TAACCATGTA GCCTATTCTG TATATTGACT GATCGCTTCC 1500
CTTTATTTCC TATAATGTAT AAACTTATTG TATGTTATAC TTTTATAATG GCCATTATCG 1560
ATTATTAAAA CTGATATTCA GAAAAAGTGA GGGTGTGTTT CGTATTTT 1608