EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:48428636-48429694 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr3:48429480-48429498TAACCACGCCCCTCTTAC+6.08
KLF16MA0741.1chr3:48429533-48429544GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr3:48429533-48429543GCCCCGCCCC+6.02
SP1MA0079.4chr3:48429479-48429494CTAACCACGCCCCTC+6.3
SP1MA0079.4chr3:48429530-48429545AAAGCCCCGCCCCCT+6.67
SP2MA0516.2chr3:48429529-48429546GAAAGCCCCGCCCCCTA+6.97
SP4MA0685.1chr3:48429479-48429496CTAACCACGCCCCTCTT+6.43
SP4MA0685.1chr3:48429530-48429547AAAGCCCCGCCCCCTAC+6.82
TWIST1MA1123.1chr3:48428654-48428667AAACATCTGGATA-6.52
ZBTB18MA0698.1chr3:48428654-48428667AAACATCTGGATA-6.92
Enhancer Sequence
TTATAGCTTC AGGTGGATAA ACATCTGGAT ACTTAAAAGT TTATATTTGA TGTCACTTCA 60
TAGATACTTA TGTATGTGTG TCTTATCATC AAATGTTCAT TCATAAATTG CACATACTTC 120
TGAATTAAAT CAGCCACAGT GCCACACGCA GGTTAACATT TTACCACCAC TCTTTACTTC 180
TCTTGTGTCT ATGAACTCCG TAACATTACA AAACTTCCCA TCATGCCACC TGTTTCCCGT 240
CTTAAAGACA CAGATGCAAT TATAGCACAT GACAATACTA ACTTCAGAAT CATAACACAA 300
AACCTGGATA AATAAATCAC CTCTATAAAC TACTGACATT GTTTTTAAAA GATAGCTCTT 360
AAAAACTCAT TTTTGCATCC CCCAAAATGC TGTTGTGCAA ACAAATGGCC AAAACACATA 420
CAAGTTTTCA ATGCTTAGTT GGTCTGTAAA TGTAATTGGC TGTTAAGTGA AAAAGTCAAT 480
TTCAAACTCT GATTAGAATT CAAAATGACG CTGTTTTAGA CACTGGTAAC AACTGTATTT 540
ATACAGTGAC ATATTAAAGA AGAGCCACTT GTCATAGTAT TTTTGCTATT TATGTCATTG 600
ATAGTTTTTT TCAACATTCC GCATATATAT TCTTTAAAGT CTGTGTGAAA TCCAAATTTA 660
CAGTGTTTAT TTTACAAGCA CACAATGCTA TTCTTTAGGT AAATGATAAA TCCATGCAAG 720
CTAATTCACC GAAAAAAAAA ATCTTTGTTC TGATAATCTT CAAAGTCTGA CCATTTGCTC 780
TGGCGTTTGG AGTGGCAGTC CTTCTCTGAT GATGTCAGTT TGGCAGATGC ATCCACAATA 840
TTCCTAACCA CGCCCCTCTT ACCTTTAGTT GATGAGGGAA TGATGTGCAA AAAGAAAGCC 900
CCGCCCCCTA CTCAATATGC AGTTTCAGTT TGAGGTCCTT CAACATACTA AAATAAGTCT 960
CAGCAACTTG CAGTAAAATT AAAAACACTT ATAAATCACC TTGAACCATC CTTGTTTTTA 1020
TTAGTATCTA ACAATTGAAG CTTGTTTCTA TGAGGGTT 1058