EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41873 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:44807353-44808962 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr3:44808229-44808245GGGGTCAGAGTTCAAA+6.23
NR2C2MA0504.1chr3:44808228-44808243CGGGGTCAGAGTTCA+7.03
PHOX2AMA0713.1chr3:44807667-44807678TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr3:44807667-44807678TAATTGAATTA-6.14
RXRBMA0855.1chr3:44808229-44808243GGGGTCAGAGTTCA+6.22
RXRGMA0856.1chr3:44808229-44808243GGGGTCAGAGTTCA+6.42
RxraMA0512.2chr3:44808229-44808243GGGGTCAGAGTTCA+6.2
SOX10MA0442.2chr3:44807493-44807504TGCTTTGTTTT-6.02
SOX21MA0866.1chr3:44808106-44808121ATCAATGCTATTGTT+6.27
Sox1MA0870.1chr3:44808106-44808121ATCAATGCTATTGTT-6.86
Enhancer Sequence
CCCTGGTACC TAAACTGCAG TTCTGCACAA GCCAGAGGAG TAATAGTCAT GCCCAACTGA 60
GCCTAGTTTT TCTTGAGTTT ATTTTCCTTT ACTTTCAACA TTTAGTGAAG TTTAATTCCT 120
CGTCACTGTC GCCACTGGCT TGCTTTGTTT TGGGACTTAT GGAGCTGCAC ATTGATGGAT 180
TTACTCTTTC AGCATTGAAA ATTAAACCAC ACTGAACTGA ACTGAACTTC AACTCTGAAA 240
ACTGGACTGA CTCAGTTTCA ATTTACTAGA ACTTCTATGC TAAGCTGCTT TGACACAATC 300
TACATTGTAA AGATTAATTG AATTAAATTG GTTGCTGTAG TATTAGTAGA ATAATTGACT 360
CTTGTCCTCC CGAGGTGTGC ATTATTTTTT AACAATTTAT TGACATTGAT TATTCCTTAC 420
TTGAATTGTT TTACTTGTTT GTTTATGTGT CACATTTGAC ACTTGTCTAG TAAGTGTTGT 480
CATTGTGTGA AAACACTGCA GGTAGAGGCT TTGAGTAAGA CTGTGAATGA ACATTTTGAA 540
GAGAGGTAAA TATTTTCATG TTCAGGGAGT AGGGATCAAT GGACATTGTG TAGGGAACTT 600
GTCAGTTGGA ACACAGTTCA TGCATGGATC TCTCTTCTAA TGAACTGGTT CTGAATCAAG 660
TGTGTTAAAT ATGAGAGACA TACAAAATTT CTGTAGTGGT AGGGCACAAG GTCTGGAATT 720
GAAAGCCATT ACCTTAAGGC AAAAAAAGAA AATATCAATG CTATTGTTTG GCAGGATCAG 780
ATATCCGTGT CTTAGTTCCC TTAAGGCTTT AAGTGGGGCA GAGATTGCTG GGTGTTCAGA 840
CTGTCCTCCG CTCACTCCAG CGGTGGTTTA AGTGGCGGGG TCAGAGTTCA AAGGCGTCTG 900
AAATGTGCAT CTGTAGCTGC TCGACTCTGG GTCAAAGCGA CCATCCAGCC GCAACATAAT 960
GTGAATTAGC AAGACAAAGA GTGCAGGAGG GGCCTGGCTT TGATTTGTCT GAGATTTATG 1020
GCCATGATGA AATCGGACCT GAATATATGC AGTTTCCCCA TTTTCTATAT CATTTACTGA 1080
GATCTAAATG GAGTGCTTTT GTTTCAGGAG ATGGACGTCT GGGATGAAAA GGCGATGGAC 1140
TGAAAGAGGG GGCATTAAGG GGAGGGTCCC GGCTGACCGG AGATGCTCTT TTCAGGTTTT 1200
CCTTCAGCTG ATGTGGATCA AAGACAAGGG TTCACAGGAA AAGAAAGGAC ACGCTGATGC 1260
CTTCAGAGGT CCTGTTCTAC TTCAACTCCA TATCAAGATG TTTACTAAGC ACATGATGAA 1320
ACATCCGTGA GAATTTAAGA TGTCAACATA TCAGAAGAGG AGATTTTAAG AGCTTTTAGG 1380
AGCTATTGGT GATGTTTTAA AGTTGGAATT AGCTATTGGT GACATTTTAA AGTTAAAATT 1440
ACAAATTCAG CAAATTTTTG AAGGCAAAAT CCAATCATTT ATACACTGTA AAAATGCTAG 1500
GTTACACACA ATTGATTTGT GTGGTGACAG CATAAAGGAA TTGGGTTCAG TAGTTTTTTC 1560
AAATTGAATT GGATTGAACA TAAAACAATT AAGTTGTCAC CCCAAAAAT 1609