EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41548 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:37942062-37942669 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:37942129-37942148TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr3:37942260-37942279CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr3:37942567-37942586TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr3:37942382-37942394ACTTCCTGTTCC-6.44
LMX1BMA0703.2chr3:37942322-37942333AATTTAATTAA+6.32
Enhancer Sequence
TTATCAACCA TGTGAAGTTT TAGGCAGTTC GGACATTGTT TGGCTGAGTT ATAAGCCAAA 60
CTGCCTTTTG TCAGCAGGTG GCGCTATGAC AGACTCAATG TTGTTATGTA GATGTGTTCA 120
GGAGGGGACT TTTATCAACC TTGTGAAGTT TCAGGCAGAT CGGACTTTGT GTGGTTGAGT 180
TATACTACAA ACTACCATCT GCCAGCAGGT GGCGCTATAA CTGTGACTTA AGATTGGCAT 240
GTAGATGCCT TCAGTAATGG AATTTAATTA ACCATGTGAA GTTTCAGGCA GATCAGACAT 300
TGTGTGGTTG AGTTATAATA ACTTCCTGTT CCATTGCGAA GCGTTGAGGT TTGTCATGCC 360
ACCACAGACA CGCCCCTCAG CAAAAACTCT AGATCTTCAC AATATATCAT CGCTAGAGCT 420
TTCAGATAAC ACCACTCTAT TTTGGTGCTG ATACGGGAAA GTTTGTGGAA GGAGTTTGTT 480
ACAGTGTCAA ACATGTCATT TCCTGTGGCC AGCAGGTGGC GCTATAACTG TAACTGGATA 540
TCGGCACGTA AACCTGTTCA GGTCAGGACT GTTATTAAAT GTGTGAATTT TGAGGCAGAT 600
CGAATAT 607