EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41547 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:37928298-37930344 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2MA1469.1chr3:37929809-37929828TAACTGTGACTCATGATTG+6.2
CTCFMA0139.1chr3:37929790-37929809CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr3:37928562-37928581TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr3:37929923-37929942TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr3:37930187-37930206CTGCCAGAAGGTGGCGCTA+7.4
CTCFMA0139.1chr3:37930054-37930073CTGCCAGCAGGTGGCACTA+8.11
CTCFMA0139.1chr3:37928693-37928712CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr3:37929000-37929019TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr3:37928815-37928827ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr3:37930307-37930319ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr3:37929122-37929134ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF14MA0740.1chr3:37929496-37929510TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr3:37929494-37929509TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr3:37929496-37929509TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr3:37929494-37929511TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr3:37929497-37929509GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr3:37929121-37929135GACTTCCTGTTTTG-6.22
ZNF263MA0528.1chr3:37929614-37929635GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA+6.05
Enhancer Sequence
GATAGGGACC TCGCACCCGG GCTCACCGCC GTCCGTTGGC CTCAGGATGA CAGAGAACAG 60
CGAACAGTAA TAATTTAAGC TGATATATTT TAAAAATCTG AGAAAATCAC CAATTTATGC 120
CAAACCTCCT CCTCTCAGCA GGTGGCGCTA TGACTGTGAC TCAAGATTGG CATGTAGATG 180
TCACCAGGAT AGGAATCTTA TCAACCATGT AAAGTTTCAG GCAGATCGAA CATTGTTTAG 240
CTGAGTTATA AGCCAAACTG CCTTTTGTCA GCAGGTGGCG CTACGACAGA CTCAATGTTG 300
TTATGTAGAT GTGTTCAGGA GAGGACTTTT ATCAACCATG TGAACTTTCA GGCAGATGGG 360
ACTTTGTGTG GTTGAGTTAT AATGCAAACT ACCATCTGCC AGCAGGTGGC GCTATAACTG 420
TGACTTAAGA TTGGCATGTA GATGCCTTCT GTAATGGAAT TTAATCAACC ATGTGAAGTT 480
TCAGGCAGAT TGGACATTGT GTGCTTGAGT TATAAGGACT TCCTGTTCCA TGGCGAAGCG 540
TTGAGGTTTG TCATGCCGCC ACGGACATGC CCCTCTGCAA AAACTCTAGA TCTTCACAAT 600
ATAACATCGA TAGAGCTTTC AGATAACACC ACTCTATTTT GGTGCTGATA CGGTCAAATT 660
TGTGGGAGGA GTTTATAACT CCGTAAATCA TGTCATTTCC TGTGGCCAGC AGGTGGCGCT 720
ATAACTGTAT CTGGATATTG GCATGTAAAC GTGTTCAGGT CATGACGCTT ATCAAACGTG 780
TGAATTTTGA GGCAGATCGG ATAATGCATG CCTGAGTTAT AACGACTTCC TGTTTTGTGG 840
CGAATCGTCA AAGTTTGCGA GGCCGCCACG GACACGCCCA TCGATGAAAA CTCTAAAGCT 900
TCGCAATTTA ACATCGCCAA GGCCTTTAGA TGACAAAACC CAATTTTGGT GTCGATCGGA 960
TAAAATCCCT AGGAGGAGTT CGTTAAAATA CAACGCCTGG AAATGGCAAA AACGCCACTT 1020
TTTCGCCGCA GGAAGTCAAA AATATCCGAC TTCCTGTTGG GTTTGAGATA TGGCTCCAAG 1080
AGACTTTTTC GTATGTTTTG GCGTGTTTGA GGTGTGTGCC AATTTTCATG CATGTGCGTG 1140
ATTCGTATAT CGGGGGCTCG TCCGTTTAAT TTTTCTAGGT GGCGCTGTCG AGTCATTTTG 1200
CCACGCCCAC TTCCAAAGCC CATAACAAAC GTAAATTTTC GCCACTTCTG ACGCGTGTGC 1260
AAAGTTGCGT GAGTTTTCTG GCATGTTTAG CCCCTCAAAA CCGCGATTCA TTCCGCGGAA 1320
GAAGAAGAAG AAGAAGAAGA ATTAAAGCTG CAAGCAGCGA TGATAGGGAC CTCGCACCCG 1380
GGCTCATCGC CGCCCGGTGG CCACAGGATG ACAGAGAACA GCAAACAGTA ATAATTTAAG 1440
CCGATATATT AAAAAAATCT GAGAAAATCA CAGATTTATG CCAAATTTCC TCCTGTCAGC 1500
AGGTGGCGCT ATAACTGTGA CTCATGATTG GCAAGTAGAT GTCTTCAGGA GAGGTAACTT 1560
ATCAACCATG TGAAGTTTTA GGCAGATCGG ACATTGTTTG GCTGAGTTAT AAGCCAAACT 1620
GCCTTTTGTC AGCAGGTGGC GCTATGACAG ACTCAATGTT GTTATGTAGA TGTGTTCAGG 1680
AGAGGACTTT TATCAACCTT GTGAAGTTTC AGCCAGATCG GACTTTGTGT GGTTGAGTTA 1740
TACTGCAAAC TACCATCTGC CAGCAGGTGG CACTATAACT GTGACTTAAG ATTGGCATGT 1800
AGATGTCTTC AGTAATGAAA TTTAATCAAC CATGTGAAGT TTCAGGCAGA TCGGAGTTTG 1860
TGTGGTTGAG TTATAAGCCA ATCTACCTTC TGCCAGAAGG TGGCGCTATG ATTGACCCAA 1920
TATTGTTATG TAGATGTGTT CAGAAGAGGA CTTTTATCAA TCATGTGAAG TTTCAGGCAG 1980
ATCAGACATT GTGTGGTTGA GTTATTATAA CTTCCTGTTC CATGGCGAAG CGTTGAGGTT 2040
TGTCAT 2046