EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41281 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:32988402-32989809 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr3:32988496-32988506AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr3:32988496-32988506AACACGTGTT-6.02
DMRTA2MA1478.1chr3:32988463-32988475AATTGTTACAAT+6.74
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:32988911-32988926TGACCTTCTGACCCT-6.58
PLAG1MA0163.1chr3:32989449-32989463GGGGGCAACGGGGG+6.64
RARAMA0729.1chr3:32988908-32988926TATTGACCTTCTGACCCT-6.58
RarbMA0857.1chr3:32988911-32988927TGACCTTCTGACCCTT-7.21
Rarg(var.2)MA0860.1chr3:32988919-32988936TGACCCTTACTGACCTA-6.35
RargMA0859.1chr3:32988910-32988926TTGACCTTCTGACCCT-7.33
ZNF410MA0752.1chr3:32988418-32988435AACATCCCATATTATTA+6.3
Enhancer Sequence
AATTAACTAG TGTAACAACA TCCCATATTA TTATGAGATA CTGAGACTTA TACATGAAAC 60
TAATTGTTAC AATTATAAGA TACTAAACTA TGTTAACACG TGTTAAAAAG TAAAATAAAA 120
TGTTGACAAA ATGTCAATGA CAAAAGGTGT TTGTCAAAAT GATGTCAATT TTAACTCATC 180
ATCTTATCTC GATGACTTGT AACGTTCTGT GTCATAACTG TGATTTATCA AAGCCTGTTT 240
TTTCCCAGTG TGAAAGAAAT AGGCGTTCAC AAAATGGGTC TAATATTGTT TTGAACCCCA 300
CTGGCTTAGA TTATATAGAC AAAATCTGAG AAAACTAATT CAATAGAGAC AACTCTCTCT 360
CTATATATAT TTTTATGGCC AACATATTTG ATCTCATCTT ATTCTGATGG CCTTGGTGAT 420
ATGGAGTTTG GACATGTTCG GCTAACATTA AGACTTGAGT GGTCAAGTCC ACTTCACCTG 480
TCTCCTGGCT ATGCATCATA ACACCCTATT GACCTTCTGA CCCTTACTGA CCTAAACAAC 540
AGATGAACAG CTCAGTGGCA CATATGGCTG TGTGTATAGC ATTAGTATAT CTGGGGCAGT 600
GCCTGTTTGA TTTGTCTATA TATTTTGTAT GTGCAGACTG AAGTATTTTA CATTTTTCTT 660
CCTGTACTAC AGTATGTATA ATGATAACAC ATCATGCTAT ACAGTCTCCT TAACAACCTC 720
ATATTTAACA GCTCTCAACA TGATATTGTT AGTCTTTTGC AATGTATAGT GACCTATATG 780
ATGAATTCTC ACTCTTTTCA CCAGTAATGG CCCGAGTGCA ATAGGGAAAT GTGCCGAGTT 840
GGTTCAAATG TTAATGGTCC ATCTGAAATC CCCTGCTTAG CCAGCAGGTT GGGGAACAAA 900
AGCTCCATAG AGGTGCAGCT TGCAGGGTCT GGACATGACA AATGCGGCTG AGACCCGGGC 960
AGTGGTTGCT GTGGAGCTCT GGGGAGGGAA AAGCGGGGGC AGTGGAATGA TCTACCAAAC 1020
CCAAGCCTCA TTGAGGACAT CGCATCGGGG GGCAACGGGG GTCATCCCAT CATCATCACC 1080
ATTTCAAAGA GGCTAAGGGC GAGGTGGAGC CGAGTAAGAG TTGGGGGAGG TCCGCTGACC 1140
CCGACCGGTG TCCCCGCGCT ACTCCATCTT CTGCAGATGG AAATGGCCTG AAAGGAAGCC 1200
CCATCATCTC TACTCCTGGC ACGACAGAGA GATATTGAGA GGCTGGGAGA CAGATAGGGG 1260
GCTGCTCTAT AAACAGTCCC ATTACCTTGA CACCCCCTAG AGGAAAGACC CTCACCCCCG 1320
ACACTCCTGC TCTTGATTTC TCATTCTGAC TCCTTTTCAG GGGGAGACAA ACACACAAAG 1380
GACCCAAAGG GACTGTGCTG TGATGGT 1407