EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41199 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:31500748-31503455 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr3:31501254-31501271AAAACGTAAACAAAGCA+6.6
IKZF1MA1508.1chr3:31501962-31501974AAAACAGGAAAT+6.11
Lhx3MA0135.1chr3:31502501-31502514AAATTAATTAATA+6.37
PHOX2AMA0713.1chr3:31502363-31502374TAATTGAATTA-6.14
POU6F1MA0628.1chr3:31502503-31502513ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:31502503-31502513ATTAATTAAT-6.02
Phox2bMA0681.1chr3:31502363-31502374TAATTGAATTA-6.14
RUNX1MA0002.2chr3:31501303-31501314AAACCACAGAG-6.14
Enhancer Sequence
TCAAAATTTG TGAGTCATGC AGCACCGGAT AACTTAAAAC AGCAACCACA AGTCTCTCCT 60
CCCTCTTCAA AAGTCTCCAT AGTTGTCTTA ACAACACAAA CACTGCTGTC ACCTCAATGG 120
AAACCCTGCC TCTGCTTTCA TTTGATTGGA GAATAAAAAA GACGCGACTG AAGTAACATG 180
CTTTTTCCAC TCAGAGTTGA CTTTTTTTTA ATTGCAAGCG CACAGCGCGC AACTGTAAAA 240
ATGCAAGGTG CCGAAGGAAA ATCATTCAAA AAATGTGCCT CTCAATGAAA AAAAGTGCGT 300
TTGGTGTGAT CGGCCCCTTA TACAACCAAT AACACACTGG AAGACAGCTA CATCTGGTCA 360
CAGCTGGACA AAAGGCTGGT TGTGAACACA CCAAACGGAC AACAAGTCGA CTGAAACAAG 420
CTCTCTGTAC CGGCAGGGGC AAAATCGTTG ACAAAAAAGT TTTGTCATTC CACAAAGGCA 480
AACTGGAACT TGTGATACAC ACATACAAAA CGTAAACAAA GCATCGTTTA GTACAATTTT 540
CACAGTGCTT GTCACAAACC ACAGAGAAAT TTGCTTGTGC GAATATAGCT TATAACCAAA 600
TAATCCATAC CATTAGCAAA TAACTGAGAA ATGCAGCCAA ATGACAGCCG GCTTCTTTGC 660
GTTCCCTCTT GATTTGTATT GCTTTCTTAG TGTTCTCACT TTGGTTTTTG TTCCTGTGTA 720
CTGATTCACT GCTGAATATA TAATCTATAA CCAATAACTG ACAAAATTGC TCCAGTGTTA 780
ACTCGATGAG GGGCAATGTG TGGAACACAT TAAACAAACT GATGGACGCT CATCGACGAC 840
TTGATGCCTA ACCACTTGGC TTGGTGTGTC TCAGCCTTTA CATAACCCGA AAACACAGTC 900
TTTACAGTGT GTTTACAGCT TTCTTGACTT TTCTTTCTCA AGTTGAGTCA GTGCGGAAAG 960
GGAGAGGAAA GAAATAAATA AAGCTCAAAC AATATATTTA ATTTAACAAT GAGTAACAAA 1020
ACAGCATATA CCTTATAACA CATAATACAT AAAAATAATG AAACATACGT GAAAATTAAG 1080
TTCTAAATAG GATTTAAACA TGAAAACTAA CTTTTAAAGT GATTTTTAAA TTAAAGATGA 1140
CTTTAGATTA ATGAGTTTAA CAGAAGCACA CCTCTCCCAT GTGGTATCAC AGCGGAAAAG 1200
GAAGAGGAGG GAGCAAAACA GGAAATTAAG ATCAGCGCTG CAGAACAAAT TCAAAGAGGA 1260
CAATGCACAA ACAGATCAGG TATACTTCAC TAACAATTTT TGTAATTCTA CATATAAAAT 1320
AAACATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 1380
ATATTGTTAA TAAGTTTAGT TTTTTTATAA GTTTTTTTTA TTTATTTACT GTATATAAAT 1440
ATTAATATAT TTGTATTATA AAGTGTGGCT AGCACTATCT CCTCACAGCA AGAAGTTCAT 1500
TGATTCCCAG CTGGGTCTGT TGGCATTTCT CTGTGAAGTG TGCATGTTTT TCCTGTGTTC 1560
GCGTTGGTTT CCTCCAAGGG CTCCAGATTT GCCCTCAGTC CAAAAACATG GGGTTTAATT 1620
GAATTAAATA AATTAGCTGT AGTGTATGAT TGTGTTTGGG TGTTTCCCAA TATTGGGTTG 1680
CGGCTGGAAG GACATGGAAT AGTTGGTGGT TCATTCGGCT GTGGCGACCT CTGAAAAAGA 1740
CTAAAATGAA GGAAAATTAA TTAATAATGC TCCAATTAAA GTGATAGTTT ACCCCTAAGT 1800
AAAGTTCTGT TATCATTTAT TCTCCCTCAT GTGGTTTTTA ACCTTTCTGA GTTTCTTCAG 1860
AAGCGTTGAA GCATGTAATT GGGAAAAAAA CTTGGATTTA AACACAAAAA TAAGTGTTTT 1920
AAAAAATGTT TAGACTTTTG TTCTTCCTTT AGTTCTTCCA GTTGTAACAG AAGTGGAGTA 1980
GGTCGGCTTC ATACACTTGG CATGATGCAA ATGTTGAAGG TTTGCCAAAG TAGAAGCTTT 2040
AGCTTAGCGT TAATACTGAT CTACACTCTT CCCAGACTTC CACTGCCTTC AGTCCCAGCT 2100
TCTGCAGGAG ACACACGCAG ATCAAAGAAC TTTCCCAGAA TGTCATTTTC ACTCTAACAG 2160
GTTTAAGAAT GCTCATGTTT TTAAACATGT TATGCTATGA TGCACGCTAA ATCTGTTAGC 2220
AAGAGCAGAC ACAGCAGAGA AACTAGACAA AACTAACCTT TATCAAAGTA GGGGAAAAGC 2280
TGTTAGATTT AGATCTTCGA TTGTGCGTAT GTGTGTTTTT GTGTGTGCAC TTTCACATTT 2340
TTAGGCATGT TTAATTAAAT AGCCTTAATC TCCTCCTCTG GGACATGAAG GGACAAGCTA 2400
AATAGTGGGC AGAGGAATGC TAACCATCAG ATCACATACT GATTACAGCA TACAGACACA 2460
CACATGCGCA CACACACAAA CACACACACA CACATTTTGC TGGAATCATG TGGCGGTTAG 2520
ATTTTACATG ATATTGTAAA AAAACTGTGT TTAGGGTTAT TTAGCATAAA AGGCACCTTT 2580
GGTTAAAACT GAGTTCCAAA TCCACCGTCT ATCAGCATCT CTCATCTGTT CAATTGCCTC 2640
TTCATATACA AACAGGAAGA CGTTCGTGTT CCTGCTTCCA CCTTCCTCTG CGAGAATGAC 2700
TTCCTGT 2707