EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41065 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:28441655-28443283 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK2MA1103.1chr3:28441846-28441857ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr3:28441846-28441857ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr3:28441843-28441860CACATGTAAACAAAGAA+6.11
LHX2MA0700.1chr3:28441824-28441834GTTAATTAGT-6.02
LHX2MA0700.1chr3:28442768-28442778GTTAATTAGT-6.02
MIXL1MA0662.1chr3:28441832-28441842GTTAATTAGA-6.02
PHOX2AMA0713.1chr3:28442142-28442153TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr3:28442142-28442153TAATTGAATTA-6.14
SIX1MA1118.1chr3:28442232-28442243GTAACCTGATA+6.62
ZNF384MA1125.1chr3:28442878-28442890TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442879-28442891TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442880-28442892TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442881-28442893TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442882-28442894TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442883-28442895TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442884-28442896TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442885-28442897TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442886-28442898TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442887-28442899TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442888-28442900TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442889-28442901TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:28442890-28442902TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:28442892-28442904TTTTTTTTTAGA-6.52
mix-aMA0621.1chr3:28441823-28441834AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
AATTTTAGTA ATGAGTTGCT AAGTTAGTTT GTCACTTTAG TTGTTTTTTC TTGTTTGTCA 60
CTCAGTCACT CTGTAATTTT TTAAAAATCC CTATTTTGTC AATTGCTTAT TTGGTTATTT 120
GGTCAGTCAG TCAGTCAGTC AGTCATTTAG TCAGTCAGTT AGTTAGTTAG TTAATTAGTT 180
AATTAGAACA CATGTAAACA AAGAAACATG TTTAGAGCCT ATTTTACATT CAGCAGAGTC 240
TTGTATATAC TGTGATGCAT TTCTCTTCTG ATAAGTTCTC AGCATGTCCA GCTGTGCATC 300
AGCTCAGTTT CGAAGACACT CTAGCAGATG TCTGGTAGTC TGCCACTGTC CTCCTGCTAT 360
GTCCTCACCT GTCCCTCCCT CTGTTTGTTG AAGACACCAG AGGATGGGGT CAGACTTCAG 420
GAATCCTTCT CTTCCGTCTG CCACGTTCTT TTAAGTATGC TTGGATTAGG ATGAGGTTAA 480
GAAGCTTTAA TTGAATTAAC CCCTTGTATC CCACACAAGC AAGACTGGAG TAAAGAAGCA 540
GGAGCTTTCT CACGGTGTGT GGCGGAAGAT CTCTGCCGTA ACCTGATACT TCAAATGTCT 600
TTGGGGAGGT TACCCTGGAA ACTGTATGAA TGAACTGACA TCGTCTGTGC GTACATGTGC 660
TTTTAATTAA AGAGGAGCCC TAATAGAGAC ATTTAGTGGC AATTCACTGT CCCTTGTGGC 720
ACAGCAAACG CATACTTCCT ACCCCTCTCT TCCGCTTCCT CTCTCGCCTT TTTACTCAAC 780
CCTATCAACA TCCGTAAAAA TCAACGTCTC CATTTCAATA AGCTCTGCTT TCACAGCCAA 840
TGGGTTACTG AAATTAAACT CTATATTTCA TGTTATTCCA AACACACATT AGAAAATATT 900
TAATTATTTT GGACCCACTG ACTTGTGTTA AGAAAAAACT CGGAATAGCG TCATTGTTCA 960
GAATGAGATG AGGGTATGAA AATGATTTCA GAAGGTTGGC ATATAAGTAG ACAGGCTAGT 1020
GGATGTTGAT TGGTTTGTCC TTGTAATTTA ATTTACTTAA ATGTATATGA TTGGTCAATT 1080
CAAGGTTTAG TTGGTTATCG TTTAGTTTAT TTTGTTAATT AGTTAGTTTA AATTATTTTG 1140
TTAGAAGCTT AGTAATCCAA GCTAGATTAT TAGGGGATTT GACTAGTTAG TTATTTAATT 1200
AGTTTGTCTT TAATCTAACA CAGTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTAGAA TATGCAAAAA 1260
TCATACAAAT ACAAGAAAAC ATCAACAAAT AACAAATACA AAGCAACGAA ACAAAAACAA 1320
AACAAAAACA ACAACAATAT AGTCAGGTAC GGGTATGTGC GTGAGTGTGT GTATGCATGT 1380
AAAGGTAACT TGGTGGACAG GTCAGAGTAC ATACATTAGG AACAATAACA GTCAATAAAT 1440
GAAGCAAGTG TCACAGATAT AGATAAAACA TATAGAAAGA AACCAGTCAG AGGTAGGGAG 1500
TAACAACAAT GCTTATTAAT GTATGATAGT AAATATGAGA GTAAAAAGAG AGAAAGGACA 1560
ACAGTAATAA CTGACAACAA TAATAATAAA TCACAAGTGC TACACCAACT ACAACTACAG 1620
AAAGTTAC 1628