EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41048 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:28204386-28205315 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:28205258-28205275TAAATTAATTAATTTAT-6.07
DMRTC2MA1479.1chr3:28204774-28204786AATTGATACACT+6.02
FOXE1MA1487.1chr3:28205275-28205290TTTGTTTGTTTTGCA-6.01
Lhx3MA0135.1chr3:28205259-28205272AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr3:28205260-28205273AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr3:28205261-28205271ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:28205261-28205271ATTAATTAAT-6.02
TFAP4MA0691.1chr3:28205153-28205163AACAGCTGAT+6.02
ZNF263MA0528.1chr3:28204525-28204546CCCCCTGCCTCTTCCTCCTCC-8.32
Enhancer Sequence
TGTCTATTTC AGGCTCGGAG CAAAGCCCTC GTTTACAAAA CTCTCTTGTT TATCAAAACA 60
CACGCAAAGC GGTGCTTGGG TGCAATGAAA GACCCATAGC AGTCGGCACC CGGTCGTCCT 120
GCTATAGCCT TCGACTTCAC CCCCTGCCTC TTCCTCCTCC ATTAGCGCAC TGAAGAGAGA 180
GTCACACAAT CCTCCCCCAC AATAGGCTTT GCTGCAAACC TGTCTGTTAG CGAGCTAAAT 240
GGCGAGCGAG ATGCCGTAAA GAGGAGAAAA TATCAGGTAA TTGATTAGAG GCGCAGGGAC 300
TGAGCCTTCA TTTGTGAAAG TGCTGCCGGG TTCAGAATCC ACATCCCGCT GCCTTGCCTT 360
ATTTCGTGGA GAATGGGAAC TCATGAGCAA TTGATACACT CCGTTAGCTC TTATCATGGC 420
GAGTGTGATC GGATGTAGCC TGAGGGATAC TTTATACAGT TTAACACTGG GACATAAAAA 480
GGTAATGTTC TCTGTGAGGA GCTGGATTAA CTGGTGAAGG CTCTCTACAC ACTGCTGAGG 540
AATAAGGACG AAGATAGTAA AAAGATGAGG AAGAAAAAAA CGACAACAAC AACAACATGC 600
ATGCTGTCAC TTTTTCATCT GAGGTTGTCG GTTATGCCCA ATGAGTTGAG CGTGGATGCA 660
ATAAAGCAAG TCTACAAGAA AAGCTTTACT GTTTATTGAG TGCCATCTGG CGCATTCAAA 720
ACAAGTGGGC AAATTAAGGA AGACGAAAGA TTTTGCGCAT TCGTGCTAAC AGCTGATATT 780
TTACCTTCCT CTGAAATGAA TCCAAAACAA GCCTTTTAAG AGTGAAAATA TGGTCCATTT 840
ATTTTATAAC AGTGTGTAGC AAGTTTCTTT TTTAAATTAA TTAATTTATT TTGTTTGTTT 900
TGCACTGGCA TGCAAGTTTG GTGAGTAAT 929