EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-41017 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:27206230-27208130 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:27208069-27208081AAAAAAACAATC-6.44
SOX13MA1120.1chr3:27206381-27206392GGCCATTGTTT-6.02
SOX15MA1152.1chr3:27206366-27206376CTATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
TTATCCTGGT GTGTTGTTTT GTCTGCGGCT CTCAGTACCT CAGTTGGTTT CAGTTGGCGC 60
TGGGATTGGA ACATTTGAGT TCACAGTAAG TGTTTTTAGT TATCGTGTAC TCATGTCTTG 120
TGTTCTGTCT GTGTAGCTAT TGTTTTGATG CGGCCATTGT TTACATCTGG CAAGTGTTGT 180
TGTTGCTTTC ATTGGCTGTG TGTTCTAGTC CTGTTTTGCG TGAGCAAAAA GACACTTGTG 240
TTGTGGTTTT GTACCATGTG GTCCCCTGTC TCCTCCCTAT TTATTCTCTC TATGTGCTCT 300
GTCCTGTGCT GAACCATCAT CGTTGTTATT GAGTCAGCCA AGCCAAGTCA TGTTAGGCCC 360
TGTTTGCAAA TTAGTGAAGT TTGTTCCTTG CTCCTGCTGC CACTGGCTGG CATGGTTCGG 420
GACTTGTGGA GCTGCGAATC AATGGATTTG CTCTTTAGTC TTTGGACTCT GAGCAGTAAA 480
AACAAAAAAT AACCCGGACT GAACTAAACT GAACTTCAAC TCTGAAAACT GGACTAATGC 540
AGTTTCAATT AATTATAATA TTCTATGTTG AGCTGCTTTG ACACAATCTA CATTGTAAAA 600
GTGCTGTAGA AATAAACATG AATTGAATTG AGTACACTAA TACATTTTAA TTCTAAAACA 660
ACATTTTAGA ACAAAAACTA TCCACGTCCA CACTGGTGTT ACACTCAGCT TTTTGAAAAA 720
CACTTTTCAC GTGGTCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACGCAC 780
GCACGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 840
ACTGTCATGG CTGCAGCATA TATTGAGGTC TGCTGACTCC TGGCAGTCAG TAAGTGTTTT 900
GAACACACCT CACCAGGTGG GAGCAGTGCA GATCAGACAG GTCATCAATG ATATACCTCT 960
AGATCTCGTC TCACTACAGT TGTTAAACAC GATATTTAAT TCATCTTGAC TCTATCTAAC 1020
GACTCTTTGG TCTTTTGAAT CTATTACTTG TTTAAGGTAA CGTGTTTTGG CTGAGCGCAA 1080
AGATAAGTTC ATATAATAAT TCAAGTAACC ACATACACTG ATTCTGAAAA CTTGACTTAT 1140
TGTTTGCGTT TATTTCCTAT ATTGTATAAA CTTGTTGAAA GGAGGCAGTG ATGTTATGGG 1200
CTCTGTTCTG TTATAAATAT GCATACAGTG AAGATGACGG TCATATATGT AGCTACACAA 1260
TGCCTTAACA TCTTTGCTGT CTGTTAAGTT AATATCAAAA TGAAAATAGG CAGTTCTTTA 1320
TATCAAGTTA TCATTTTATT CTAAAGATAG TGAAACAATG TAGCAAGGGG GATATGAATG 1380
ATAATATAAA GTACACCATT GGGAGTCCTT GGGAGTTTGC TTTCCATACC AAACTTGCAA 1440
AGTCTGAACT TACAACTAAA GGATGCAGGA CTCAACTTTC TGTACTTGAT ATTGAGAAAA 1500
GGCCCCAATC AGAAAGGCGA ATGTCTGCAG CCACACCTCC ATCTTCATTC AAATTGAATG 1560
GAAAAGTTTT GTGGCATGTA TGTGTTTTGT TTTTTTCTAC ACAATTAAAC ATTTGAATGA 1620
ACATCTTCCA ACAGTGGCAA TTCCATACTT TTTGGCAGAG ATTGTAACAA CTTAAAAACA 1680
TTAGCAAATG CTTTCCTTTC ATCTAGGCTA AAAGAAATAA GACTTACTCC AAAAGAAAAA 1740
AAAATCTAAA TGGAAACACT GTAGAAAAGA GTCATAGCTT TTTAATCTCA CAAATATTAA 1800
AAATTTCACT ACTGGTAAAA TATATAGAAT GTGTATGATA AAAAAACAAT CCCTGAAACA 1860
TAAAAGCATT GAAAATTGCA AAAAGCCCCA GTGGAATTAT 1900