EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40818 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:23819840-23820787 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr3:23820378-23820395AGTTCATTCAGAGGTCA+7.17
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:23820378-23820395AGTTCATTCAGAGGTCA+6.92
Enhancer Sequence
ACAATAACAC ATTAAAAATT AAGGCAAATT TGATGATTGC ATTCATTGCA TCATTTGTTT 60
ATAATTTTTA TTAAAATAAT AGGATACATT TTAATAGCAT TCTCATGTCT TTTACTTTTG 120
TAATATGGTA TTAAATATTT GCAAACACAT TTACATTATC ACTACTTCCA GCATTGTATT 180
AAAGGTAAAA TGCTAACCGG CTTTTCTAGC ATTGCAGCAC TGAAAGTTTT TCTCTTTCAC 240
TCCGATTCTT TGGACTCGCT TTTATTTGTT TTACTAATCT TTCCGCCGTC TTTTCATCCA 300
CAAATCCCCC ATTTCCAAAG CTCCGCCCTC TGCTCCACGG AGTCCCCGGT CTCGGTCTGC 360
AGCAGTGTGC GCTGGATCTG CGCGTGTGAC AGCAGCACCT CTGCTAATGA GGAGAGATGT 420
GTGCGGGGTG CAGCTCTGAG GCCCATCAGC CGGATCGCAT GTCTCTAACG AGCAACCTGG 480
CGACTGCAGC CCGTCAGACT CACCCCCGCG CCCGCCTTCT GCTTCACCTC TCCCGCACAG 540
TTCATTCAGA GGTCACGGCC CGGGTCCGCC GCGCGCTTCC TGAGAGCCGG ATTCGGGAAA 600
ACAAGAGTCA ACAGACACGC CGATCATTTG TTGTTGTTTG TTTGCTTGGG TTTTAATTCT 660
GCCGTTCTCT GCACTGGACT TGGGCACATA CTGCATTGCA ATAACTCAAT AGTACACAGT 720
CTCTAAACGA AAAGTTAACT GAGGCCAGAG AAGCTGAAGA CTGACAACAG ATAGGCTATA 780
TTGGCAGTTC AGGCACAACA CGACAATAGC CGAACACCCA ATGGGGAAAG AAAAAAAAAA 840
GAATTATTGC AATTACTTTT CACTAACAAA TTTAATTAGC CTTTGTTCAA TTAATGCTTC 900
TGCGATTTGA TGACGCTTTC AAAAAGATTG TATGTGTTTG GACAGTT 947