EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40812 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:23795816-23797439 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:23797072-23797087CCGACCTTTGAACTG-6.13
Lhx3MA0135.1chr3:23796230-23796243AAATTAATTTATT+6
MEF2AMA0052.3chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.18
MEF2BMA0660.1chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.62
MEF2DMA0773.1chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.37
RARA(var.2)MA0730.1chr3:23796667-23796684AGGTCAAACGGCGGTCA+6.01
RXRGMA0856.1chr3:23797073-23797087CGACCTTTGAACTG-6.09
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:23796667-23796684AGGTCAAACGGCGGTCA+6.25
ZNF24MA1124.1chr3:23796907-23796920GAATGAATGAACA-6.3
Enhancer Sequence
GAAGATGAAG TGATGTCAAA ATCATTACAG CATGGTGGAA GTAATTTCTT TTAGCACTTT 60
CAACTTTTAA ATGCATTTTT TTGTTGTTGT TGCATTAGCT CAAAAATAGC CTTATGAACA 120
AAAAAACAAC AACTTTAGTT TTCATTGAGA CTTTAAAAAT TCATGGCAGA AAAGAAAATC 180
TAACATTGCA AGAAAAAACT GCAATAAGTA ATAACAATAG CAGAAATTCT GTGAGAAAAA 240
AAACAATTGT GCAAAATTAT TGCAACTAAT GTGAAAATAC AAATCACACA CACAAAAAAC 300
TGCAAACTAC TAATATTGAA TCAAATAAAA AGTCACAATT CTGAGGTCAA AATGTTGCTA 360
ATAAATCTGC AAGTAAAGTA AGACGGTACA GCTGAGAAAG ATAAATGATT AGCTAAATTA 420
ATTTATTTCA TATAAACCCG TGTAGGAACT CTACGTAAAC TTGCACTACA AAAGGAAAAC 480
CTGCAACTTG ACATGCTTTT ACAAGTCTAT ACTTCATGTA TTTCTGATCG TTGAAAGGTT 540
TGAAACTCAG CCAACAACTC TAATCTCTCT CTTTTATTTA TCAAGACACA AAGAGCTGTG 600
TGTTTGTTTA CGGCTATGTG TGTCAAAACT CCTGTAACAT TCCAAGCGAG GTCACGGCTG 660
GGTTAAGGAG GGGTCAGAGG TTCTCCGTGA GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 720
GTGTGTTCAG CAGAAGAATG TCAGAGGCCC ACTGGCCATC AGTCTGCTGG GGAAGGAGGG 780
ACAGACTGGA GGGGAGCGGA GGTGAAGGAT GGGAGTTTGG GGTGAAGGGG AGGTGAGGGG 840
GCACTCAGGG AAGGTCAAAC GGCGGTCAAA TACAAAACAC ACTCACAGTC GAACCAGTCG 900
GTCCAGCTCG CCCTACATTC CAACTTACCA GATGACCATT TCCTTTTCAC TCACACACTC 960
ACACACAGAG CTAGAGGCTA TTTTTAGTGT TCTTACAGAA AGAAAACTAG GGAATGTGGG 1020
TGGCAAATCC CACGGTGCCC TTCAGCCCCC CTCTGCCTCG CCCTGTACAA TGGCAGAGCC 1080
TGAATCCCCA TGAATGAATG AACACAACAT GCAACCCGCA TCCTAAACTG GTATCAATGC 1140
ACAAAGCGTG GTCTTCTCTT CCAGACTGGC ACATAGCAGA AGACCCCCAC TGTCCTTAAC 1200
ACCCCCAGCC ACACATAATC TGACCCCCGT CCAGCCCTGA TGGCTAAAAA ATGAGACCGA 1260
CCTTTGAACT GAAGTCGCTC TCTCTCTCTG TGGGCGCAGA TGACAGACCA CAAATCAGAC 1320
TCGTCGTGCA AAGCATGTGG AGATTTCACT TCATAGAGCT GTGTTAATCT GCTTTAAGTG 1380
TACCTGAATA ACACCTCAAT TATTAATTAG TTAACACAGT TAATAATGTC TTGTAGAATC 1440
TACAGTAACT CTCTAGCAGC AGTTCACCAG TAACTTACTG TAAATTGTTT ACAGCTAAAA 1500
TACTGCATTT ATGTTTAAAA TACTTTTTAT CTTGATGTAT AACAGTTGAC GTCATAATTA 1560
TTAGCCCCCC TTTAAATGTT CTTTTCTTTT TCAAATATTT CCCAAATGAT GCTTAACAAA 1620
GAA 1623