EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40746 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:23427322-23429552 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr3:23428980-23428996TGGGTCAAAGTTCACG+6.7
NR2C2MA0504.1chr3:23428390-23428405CAACCTTTGACCCCT-6.18
Nr2f6MA0677.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.15
RXRBMA0855.1chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.16
RXRBMA0855.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.69
RXRGMA0856.1chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.4
RXRGMA0856.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.77
RxraMA0512.2chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.29
RxraMA0512.2chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.64
ZNF263MA0528.1chr3:23428301-23428322GGGGGAGAAAGAGAGAGAGAG+6.49
ZNF384MA1125.1chr3:23428013-23428025TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
TGTTGCAATG ATTTAAATTG ACTGCTGTCA TTTGTAAATT TTGACAGTTT GACAGGTTTG 60
AATTAAAATG GGACAAATTT TATGTATGTA AAGAAACACT GAAATGCATA ATATATATCT 120
CTGGCCATTC AAGCATTCAA ACAGAAGAGG AAGTTGGCAT TGTGTTTCAT CGATTTGAGA 180
CAAGCGTTAG ACCGCTGTAG AGCACAGAGA GTTAATTTTT TATGCTATCT GGCAAGCAGA 240
AAAATCTGAA TAAATATTTC ATAGCCCATG TAAAAGTGAC CAGTGACTGT AAAGTGTCTT 300
TCTAAAATGC ATTTGATAAA GTCAAAGAAT TGAGAAGCAC AGTGTTAAGT TCTAACCTTC 360
ACAGACGCAA ACAATACTGA ACTGTTGAAC GAATGTAAGA GACCCAAACT TTAAACAAGC 420
AGTATACTTT GCCCTCAATT TATGTGAATT GATGCCGTTT TTTGCCTGAT GCCTAAGAAT 480
ATTGTTTTAA TTTTGCTTTG TTGAACTTTG TCAGATCTGA GAATTGCAGT TGTGGATTTT 540
GTGCAATAAA TATTTAAAAT CAAGACAATA TTCTTATCTG CTGTGCACAA ATTTATGCAC 600
CAACTATTTA AACAACTATC TTAAAGTTAC AAGTTATTTA AAACAAAGAG ATTTTTAGGT 660
TCAGTGTCAT TTAGCAAATC AAGCACATTA CTTTTTTTTT TTACGAAGGT CTAATCAAAT 720
AGACTACTGC ACAGGGTACC CACTTTGCTT TTGACTGCAA ATTTCTAAGC ATGTCAAAGT 780
GTGCAGGGAG CGACATGCTC AGCTGAGGAA TGCAATGCTT CTAAAACGGC AGCCGGTGGG 840
GGTGAAACGA AAAGAACCTG AGGTCTTTCC TGCATTATCA TGTGAAACAC CCCTCCCTCT 900
CATCCGTCAT CCTCTTTCTC GCTCTCTCTC TTGCTCCCTT GGCCATTTGA GTGAGAAGGG 960
AAGCCACAGG AATGGATGGG GGGGAGAAAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAATTTCAT 1020
CTCATCGACA AAGAGTTTTG TCTGCAAGTA GTTCTCAACC TTGCATCGCA ACCTTTGACC 1080
CCTATGTGGA TGGGGATTGC TCTGGTCAGG ACTTTAAAGA GCCACAGGGC AGGGTAGGGC 1140
AGGGGACTGG GGTTACTAGC AAACAATTGA ACTTTTCAAA GAGGCTGTAG ATTATGCTGA 1200
GGTATGGCAG TGCTGTTAAA AGGGGGGAAG GGATTGCAGG ACATAAAACA GCAAATATTA 1260
ATTTATTTTG TTAAATTTGT GGCACACTTC ATATACAAAC TAAGAAATCA AAATATAAAA 1320
AATAATCCTG CACTAAAATA GGCTAAAAAG GTGTTGTCTA AATCATAATT CATAAGTAAT 1380
AACAGAAGGC ACATTGTTTA AATGTTTTAT AAGTTGAGCA CAATATGTAG CAGATAATCT 1440
CTATTAGGCT TGTGCGATAT TTACGTAAAT CGTGTGTAGC CGATGAAGGG TACTCAAGTG 1500
AAAAGCTGCA TGCGTGTTTG CGTCTTTCCA AAAATTACAT ATGTATAAGC ATTACCCCCT 1560
CCGGTGGAGT TGCTTTTATG GGTGGTATGT GAGAAACAAC TGTAGATAGC GACAACTCTG 1620
GGATCCGTTT AGTTTACAAA GGCGATATGC CCTAAGTTTG GGTCAAAGTT CACGCTTTGC 1680
TCTGCTGTGG AGAAGATGGA AGCGTTTGTG CGCCTCCATT TTGTGACTCA CGAGTAGGCT 1740
AGAACATGGG ACAGCATGAC TAAATCGAGT AAAGAGACGC AAACTGAACA CAATACGAGC 1800
AAAAAATTAA TGCATCGGTT AAATTCACGC TCAAAGTTAT TTCACATAAA AAAATCGCTC 1860
GATTTATGAA GAAATCAAGA AGACTGACGG TAAACCAAGG CGGCGTAATT TGACAAACAT 1920
CACAATGAGC TGTGAATACA GATGTCTGGA GGACTTTTGT ACGTTAATCA GTTTTCTAAA 1980
CTAACCAGTG ACATAAAATC GACTTGTATT GAATATTGTA CCTGTAAGCA TCTATAATAA 2040
ATCTGAATAA AGTAATGCCA CCCTCCCCCT GCCTCGCATG TTCGCCATTT CATGAGCCAA 2100
GAGTTCAGGA AAAAAACGAA ATGGTAGGTT GCACTCCAAA AACACACTTA TTCAGCCTCA 2160
AAACACACGC ATTTATATTT CAGAAAATAC AAAACGAATG TTCATAATTT TATAAATGAT 2220
CACACGAGTT 2230