EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40606 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:21088156-21089296 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr3:21088956-21088967GTTTTATTGGC-6.14
HOXB13MA0901.2chr3:21088956-21088967GTTTTATTGGC-6.14
HOXD13MA0909.2chr3:21088956-21088967GTTTTATTGGC-6.14
ZNF263MA0528.1chr3:21089051-21089072GGGGGAGAGAGAGGGGGAGGA+7.84
Enhancer Sequence
CTACTGTAAA TATATCAACT CAATTTCTAA TGTGTAATGT ACATTGCTAA GCACTTCATT 60
CGACAGCTTT AAAGGTGATA TTTCCAATGT TTTAGATTTT TCTAAACCCT AAAAGAGTTG 120
AAACCTTACA CAAAACGTAT GCGTTAATGG AAATTTTATT TATCAGCCTG CGCTTAATAA 180
TAAAAAAATT ACTGGACACT TATGACTGGT TTTATGGTCA TGTATTAAAG CAGAAAACAA 240
TATATTTAAA ATTGTAATAA CATTTTTTGT TGTGTTTCTC TGTAAATAAT GCAGCTTTGG 300
TGAGGAATCA GTCTAAAGAA TCAACTTTTT ACTTGAACAG TAGTTTTAAA CTCATATGCA 360
CTTTACTGTT TGTAATAACA TGTCAACATG AAGCAATACA AATGCAACTC AGTCCCTTTT 420
GTGTGTAAAT AAAGTGTTGG AGAACTGTGA AATTAAACTA ATACTTTTGC TTTCTTTTGC 480
CTGAAAGCTC AAAACAACAA GATGCCTTGA AATGAATAGG AAAGAGTAGT GACTTACCCA 540
CACTGGAATT TACCTGAAAA CATGAACTCG ACTCCAGGAT ATTCAGGCCT ATTTGAAATC 600
AGCAGAATGT TTGTTACTGA TACAACATAC CTCAACAGTA CGTGCACAGC GAATACGTGC 660
ACATAATAAT AAGAAATAGG AAATTCTGAA CAAAAATGTT TATTCAGTTT TCGGGTTTTA 720
GTTCATTTGA GTTTACCAAT GTGCAAAATG TGGTTAAGGG CTCTATCTTG TGGTCTTCTT 780
TTCTTTTTCT TCTTCTTTGG GTTTTATTGG CGGTTGGCAA ACAGACTTAT AGGTGCATTA 840
CCGCCACCGA CTGGTATGGA GGATGGACTA GTTGAATAAT AACTGAAATG ACTTGGGGGG 900
AGAGAGAGGG GGAGGACATT GTGAGGGGGG AGATAAATAA CAAAAATAAT AATAAAAAAA 960
ATTACATTTC AAAATAAAAT TGGGGGAAGG GGTGGGCTAA CAATTAATTC TTCTGATTAT 1020
ATTAGATCTA TATTCTTTTC TCTAACTGGG TTTCTTTATT AAATTTCATT ATATCGTTAT 1080
ATACCTCACT AGATTTATTT CCTAATAAAC CTGCCAATTT GAAATCCTGA AGTTTGCTCT 1140