EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40552 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:19716963-19717560 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:19717393-19717406AAATTAATTAATC+7.82
POU6F1MA0628.1chr3:19717395-19717405ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:19717395-19717405ATTAATTAAT-6.02
SOX21MA0866.1chr3:19717080-19717095AACAATTACATTGTG+6.41
Sox11MA0869.1chr3:19717080-19717095AACAATTACATTGTG+6.62
Sox1MA0870.1chr3:19717080-19717095AACAATTACATTGTG+7.29
ZNF384MA1125.1chr3:19717458-19717470TCTAAAAAAAAA+6.52
Enhancer Sequence
TCACGACCAC ATAATTGTTG GCATCTGTGT TTAGGTGAAG CTTGTGTTTT TGTGTAAATC 60
CACAATGTCG TCATCCTCCC ACTGCAAAAC ACCCACAAAC AAAAACTTCT CTTAGTCAAC 120
AATTACATTG TGTTTTCACT GCGAGACACG GGATTCACTG CCGCTTGGGG TCAGTAAGGT 180
TTTAGGTTTA TTAAAAGAAG CCTATTTTGG TCACCAATGC CGCATTTATT TGATCAAAAA 240
AGACAGAAAC TGTACAATTG CGAATTATTG TTACAATTTA AATAGTTTTT TATTGAATAT 300
ACAGTAGTTT CAAACTGGTA TTTGTTCATG TGATTTATTT TTTAGCATCA TTATTTTAGT 360
CTTGTCGCTC AATAAATATT TACCAGTCCC TTCAAAGTCC AATTGTATAA ATAAATATAT 420
AAATAAAATA AAATTAATTA ATCAAATATA TTTATAAGTA ACAAAATATT TACGTATTTT 480
TTGTCTATTT TCAAGTCTAA AAAAAAAATA TTGCTAAATG TTTCGGGAAA TGCGATCACA 540
AAATCATAAT TATACAGTGT TTGGCATAAA TGTATACACC CTCAAAAGTC TATCTTT 597