EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40488 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:17972173-17973099 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MIXL1MA0662.1chr3:17972989-17972999GTTAATTAGA-6.02
PHOX2AMA0713.1chr3:17972991-17973002TAATTAGATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:17972991-17973002TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr3:17972991-17973002TAATTAGATTA-6.32
SIX2MA1119.1chr3:17972639-17972655AGATCATGTTTCAGCC-6.19
ZNF24MA1124.1chr3:17972245-17972258GTATGAATGAATG-6.64
ZNF24MA1124.1chr3:17972249-17972262GAATGAATGAATC-6.74
ZNF384MA1125.1chr3:17973065-17973077TCTAAAAAAAAA+6.52
ZNF384MA1125.1chr3:17972200-17972212AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TTGACACGAC ATGCAATACT CGTTTTTAAT AAAAAAAAAG GAATGATTAA GTTGACGAAT 60
GAACACATTA AGGTATGAAT GAATGAATCA CTCCGCCATA ATGAATGTTT TACGAGTTTT 120
CAAAGCAATC TCGTGGGTGA GTGAGCAGAA TAATGGGACA TCACGATGCT GCTGTCTTTT 180
ATTTCCAGAA GAATCCTCTG CTTCAGTGCT TAATTCATCA ATAAGGAATA ATTTATGGGC 240
GAGCTTAATG GGTCAGCAGC TTCATTTAGA AAGCTGGCTG GAGTGGATAT GGGGATCTGG 300
AACACGATAC ACCTAATCTG ATTCCTAAAA TCAAACTGAA CGTCTTGGGG AGTTACAGCT 360
ACATGCCTGA AACATGTCGA ATATATAGTG TCGATTTCAG ACATGCCTGT CATATGACTG 420
TGGATATTAA CGATGACTGA ATATTAGCAA TGCTGAGCAC ATTTCAAGAT CATGTTTCAG 480
CCCACAGTAA TACAAGAAAT TATGCTTTCC TTGAATGAAA ATGAGGCAAA TCGTTGTGTC 540
ATGCAAATTA TTTTAATCGT GTTTAAATCA CATACAGTAG AAGTCAGAAT TATTAGCCCT 600
CCCTGAATTA TCCTAAATTA TTTTATAAAT TTTTTCCCCA ATTTCTGTTT ACCAGAGAGA 660
TTTTTTCAAC ACATTTCTAA ACATCATAGT TTTAATAACT CATCTCCAAT AATGGATTTA 720
TTTTATCTTT GCCATGATGA CAGTAAATAA TATTTGACCA TATATTTTTG AAGATATTTC 780
TATACAGCTT AAAGTGACAT TTAAAGGCTC AACTAGGTTA ATTAGATTAA CTATAGGCAG 840
GTTAGGGTAT TTAGGCAAGT TATTGTATAA TGATGGTTTG TTCTGTAGAC TATCTAAAAA 900
AAAAGAAAAG AAAAAATTGT TCAAAC 926