EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40421 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:16319653-16320515 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr3:16320380-16320391AATGTATCAAA+6.02
DMRTA2MA1478.1chr3:16320380-16320392AATGTATCAAAT-6.04
DMRTC2MA1479.1chr3:16320380-16320392AATGTATCAAAT-6.74
LHX2MA0700.1chr3:16320317-16320327GTTAATTAGT-6.02
POU4F3MA0791.1chr3:16320076-16320092ATGCATTATTCATAAG+6.36
Enhancer Sequence
CATCTTTGTA GAAATCTGTA TGGTATTCAG AAATTTGTTT ATATTTCTAT AGTTGCTGTA 60
TTACATCAGT AACGATAGAA TTATCACAAC AGATTAATTC AAGTGCTTTA CTAGTATGTT 120
TCAAAAGCAC TATATTTAGT ATTAATACCG TATTTTTTGT GACCAGAACT CCAAAGGCAA 180
GTTTTAAACC CCATGACCTT CAAATTAAAA TGTCAATTTA CCTGTTGTAC ATATCGATAA 240
AAACATCTTT TCAGGTGGAG ATGCTGAATT GGCAGTCAGG GGATTGTTTT AGTCTGGTAT 300
CACGAATTGC TGAACAGCAT GGACCTTTGT ACACACAGAC AAGAGACAGA GAATGCAATT 360
TTTAAAAATT AATCAGTGTT GTGAAAATGT AACACAATGA AGAGGCCGTC GTTTCAAAGC 420
AACATGCATT ATTCATAAGT AATTACTGAC AAAGGAGCCG TCAGAAATTT AATTAGCAAG 480
CTCGCACACC TGCCGCGCTA GTCTCTCTCG GTGTGTCTAT AACGTTAGCT TACATAAAAA 540
CACAGCATTT CAGACACTTA CAGCCAGGAA AAACATTTCA AGGCGCATAC ATGATGTGAA 600
ACGATATCGA GACGTTGTTG TATAAGGGAA TTATAGCCGC CCGTCCTCAC TTCAGATGCT 660
ATCGGTTAAT TAGTTTTTTG GCTAAATGCC TTTTCGACGC TCTAAAACAC ACCATAGGCC 720
ATTACGAAAT GTATCAAATA CCTAGTTCAC ATATGACTTA TTAAATCTTC GAGAAAATAT 780
ATGAATATAC AAATAGGGAG ATCCCACTAT TGTAACATTA AGCAGAAATG TACAGCAAGA 840
TGTTTGTTTT TACTGACAAC TT 862