EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40297 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:13111842-13112925 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:13112204-13112216AAATGTTTGTTT+6.27
Foxd3MA0041.1chr3:13112208-13112220GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxo1MA0480.1chr3:13112285-13112296TGTAAACAGGA-6.62
PBX2MA1113.1chr3:13112251-13112263GCTGTCAATCAA-6.32
Enhancer Sequence
CTGCTTCTAC CATACTAGTC AATCTTAGTT AATAGTAGTT GTTGTTTTCC GCCACTAGAG 60
TGCAGCACAT TCAGCTGCTT TTGTCCTCGG TTTGCGTGGT TGTGCTATAT GTGGGTTGTG 120
ACCTGAAAAG TTCTCAAATG CACATTATTT ATTGATGTTT TATGGGAAGT TGGTCATGAG 180
GCTGTGCTAA AAACGCCAGA TACTTTCTCT CAAATATCTC TTCTGTGTTC ATTTCACTGT 240
CATGTGCTGA AATAATTTTT TTACAGATCT TAAAGTCTTT GTCCTGCTTA AAATTAAGAC 300
AAAAGTTTAG TTTCTAACGG ATTTTTTTTT CAATTTTCTG TCGTTAAAGT GCTTTAAAGG 360
TTAAATGTTT GTTTGTTTTT TTACCTCAGC GCTCATTAAT CTCAAAATGG CTGTCAATCA 420
AAGCAAATAA GGCGGAGCGT TTCTGTAAAC AGGAACCAAA CGTGGATTTT TTCCCGCAAC 480
ACTTCAGTTT TTAACGGTGA AACTAAAGTA AGATGTCTGT ATCTTGTTTC ATTATGCTTT 540
GTAATGGAAT ATAACATGAC AGATCGTAAT ATGAAGCAAA CTACAGGACT TTTTAGTAAT 600
TTTTTTGTCT GTTTTGATTT GAAAGCGAAG ACATTCTAAA AAAGTTTTCG TGGAATTCTA 660
TTAGAATGTG ACGTGAAGAA ACATTCCATT TAATCTACAA TACAAACATA CCTCAAGATA 720
TCTTGTATTC TTTTAAATCT AATTCAGTTT TTGTCTTCAT TTCTTTTATT CAATTCCAAC 780
TAAAGCAAAC ATAGTCTAAT TTTCATAACC CTTTAACTAC CCCACCAAGC AAAAAATGTT 840
ATCAAAAATA TCAACTTCTA CCAAATGGTT GATGTCAGTT TATGTTAAAA GTACCGGAAT 900
TAATACATAA ACTATGAAAA ATATGAAAAT ATGACGCTTA AGACCAATTT ATTAAAAAAA 960
ATATTCATAA TAAAACATTG AATGAAATAT TGAATACTAA ATCACCTTTT TTTCCAAGTA 1020
TGTCATAAAA TATCAGATTC TTATTTTAGA TATTTTCTTG TTTTTTTTTT CAAAATCAAG 1080
TGT 1083