EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40280 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:12929421-12930849 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:12929753-12929767TAAACGTAAACAAA+7.47
Foxj3MA0851.1chr3:12929753-12929770TAAACGTAAACAAAAAT+6.22
NFKB1MA0105.4chr3:12930590-12930603TGGGGATTCCCCC+6.12
NFKB1MA0105.4chr3:12930590-12930603TGGGGATTCCCCC-6.16
NFKB2MA0778.1chr3:12930590-12930603TGGGGATTCCCCC-6.22
NFKB2MA0778.1chr3:12930590-12930603TGGGGATTCCCCC+6.54
PHOX2AMA0713.1chr3:12930181-12930192TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr3:12930181-12930192TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:12930181-12930192TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr3:12930181-12930192TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
ACACTGCAAA AAATGCTTTT CTTGCTTAGA TTTTTTGTCT TGTTTCTAGT CTAAATATCT 60
AAACTTTCTT ATATCAAGAA GCATTTTCTA GACAAGCAAA ACATATTGTC CTGTTTTGAG 120
AAATAATATA CCAATATTAA GTGAGTTTTT TTCTTTAAAC AAGCAAAATA ATCTGCCAAT 180
GGGGTAAGCA AAATAATCTT GTTTTTTCTT TTGACGTAAA ATTATTTTGC TTACCCCATT 240
GCTTACCCCA TTTTGCATAC TCTTCTGCTC GACGCCAGTG AAAATCGCTT GGGTTTAAAT 300
CCGGAAAAAA CGTCTCGAAA AATCGCTGAC GATAAACGTA AACAAAAATC GTCCCGGTGT 360
GTACGAGCCT TAATACCGTA TACCAAAGTA AAATAGGGAG GAAGTTTGAT GGTATCAAAA 420
CCAAGATGGT ACCCGCCAAG CCTAAAAATA CTGCAGAAGT AATGTTCATT GTTAGTAAAT 480
GTGAAGTAAT GTAGTTAACA TTGTAAAGTG TTTTTCATTT AATATAATAA ACTAAATAAT 540
ATATTTTACT AATATATTTT AAGACACAAA AAAATCTACT AAAATAGTAA ATAAAAATAC 600
TTTAAATTAA TATAATATAA TTATATTGTT ATATTAAACA ATTCTAATGT AATCATCTAA 660
TATATATATA TATATATTAA TATTTTTTAT AATATAATAA ATATTAAATA TTTTAAATAT 720
TATAAGACTA TATATTTTTG TTTATTAAAA TGTATTACAA TAATTTAATT ATTTTTATAA 780
TACTATATTA TTGTACAATA ATAATAATGT ATTTTTCCTC TCATTTTTAC AGATTTGTTT 840
CTATATTTAC TATTTATTTT TACGATATCT ACGTGTGTTA CACCAACATT TTTAACAAAA 900
CATTGGTGGC CATAAAAGCA AGACCAAACA AAACATGTAT GAACGGTTGC TAAAATGCGT 960
TCCTTTGAGT TGTATTTCCA TGAATATAAA AGTAATTGCA TGCATTATAC TTCAGAGGAA 1020
GCAGTAATGC AATGATTAGA GGCATTGAAG CTCATATTCC AGCCTTGAGA GCGAATAATG 1080
GAGCATCTGG TAGGTGGTCT TCAGTCTTTC AGGAGTTTAC TGAGTGTAAA GGATGTTTAT 1140
TTAAAGCGCT CTCATCAGTT GTCTGCCAGT GGGGATTCCC CCGACTCGAA CCCTGCGGCA 1200
TTACCAGACA CACGGCTTCA CTGTGAGATG AGGATGATGG CTCTCTGGGG GTCTGAACCG 1260
CGGGTATTTT AGTGAGATGA AGTGGTTAAA ACAGCCATTA ACAAAACATG GTGGTTAAGC 1320
TCAGTGAGTG TGATGTCATG GAGAATGATG TCAGGAGGAG GGAAGATCAG AGGAAAGTGT 1380
TGAGGTAAAG TGAGGGGAAA GGCATTGAGA AGGTGGCTGG TGACGAGC 1428