EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40223 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:11841310-11842506 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:11842251-11842262ATTTTAATTAA+6.62
Lhx3MA0135.1chr3:11841867-11841880AAATTAATTTTCC+6
MEF2AMA0052.3chr3:11841892-11841904TCTATTTTTAGT-6.27
MEF2BMA0660.1chr3:11841892-11841904TCTATTTTTAGT-6.32
MEF2DMA0773.1chr3:11841892-11841904TCTATTTTTAGT-6.92
ZNF384MA1125.1chr3:11841812-11841824TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:11841813-11841825TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr3:11841820-11841832TTTAAAAAAAAA+7.22
ZNF384MA1125.1chr3:11841814-11841826TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TAGTTGCATT TTTTGAGAGG TGGGCATCAT TGCAAGCCAC GTCAAGGGCT ATGTGACACA 60
AAGGCTGCGC CAGAGCATAC AAGTGCGATT GATGCAGAAG TATAAATCCA CCTTAAGACT 120
TCAGTCCTGA ACAGATCGGG GTAACGGATC CGGCATGTTA CTCGAGGATG GAGAGGTGTC 180
GAAAGTGAAG AGGGTTGGGA AGTCGAAAGT GAACAGCAGA TGGGGGAGGA GGCCGGTTGA 240
GGAGGGGGAT CGGTAAAATC AGGTGCCAGA TTAGTTTTCA GAGGTGCCGG ATCCGGCATG 300
TTCTGGCATC CATTGCTTAG CAACATATAC AAAACAACGT AAAGACCGCT TGACGTGAAG 360
TAAATAAACC AGTAGAGGAG CTGTTGTTAA TTGCGTCAGC ATCTGCTACA GTCACAATAG 420
ATTTACAATG TAATACACCA TAAGTTAGTG TGAAGAGCAT GTTGTTTTCC TGTGGCCGAG 480
TGAAATAAGT CATCAATCAA GCTTTTTTTT TTTAAAAAAA AAGGAAAATA AAATAAATAA 540
ATTGCACATG TGCCACTAAA TTAATTTTCC AGTTCGCACA CGTCTATTTT TAGTCGCGGA 600
TGCAAGCAAA ATGGTCGCAC TTTCGAGCCC GGACAAACAC AAGCATTTTT ACCAAGAACT 660
TGCCCAATTT TTCAATGTAG TAGTAAATCA TTTAAGCTAA TAATACAACA ACTACAACAA 720
CAGTGTGCTT ATGATTATGG TAATGATTTT GAACAACAAA TAGCTGCTTG CAACATAAAT 780
CAGCATGAAG CCATTTTGCA TATTCAAGAT AAACGTTTTC CTTTTTTCAC AAAGAAACAG 840
AAATGAACAA ACCATTTTCA TGCAGATTAT TCACAAAACC TTCATTAATC TTTGCCAGTG 900
TTTTTTCTGT CAGATATCTA ACAGTCCTTC TGTTGATGTG CATTTTAATT AAGAGCATTC 960
AGAGGTAACT CTTAATGCGT TTCTGCTCTG AGAACAGTTC GGTCATGGCA ACTACAAGGG 1020
GCTCTTTACT GCAGGAATGC TGGATTTCAG ACCCTCACAT TCCTCGCTGT GGGTGCTGTG 1080
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTAAGAG 1140
AGAGAAGGAG AGTTGGATAG TTCATGTGGA TGTGTATAGT ATGAGTAGGG CTGCAT 1196