EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40181 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:10160725-10162655 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:10162341-10162354AAATAATTAATTT-6.78
POU4F1MA0790.1chr3:10162339-10162353TTAAATAATTAATT+6.01
ZNF143MA0088.2chr3:10161207-10161223TACCCACAATACACTT+6.34
Enhancer Sequence
TGTTTCTTTA ACCTGCAAAT TTTTATTTTA CAAATTTTAT AGATCAAACA GTACTGTATG 60
CTTCTCAAGC TAACTTATAT GAGAAGTGTC TACAGTCAGA AGACAATCGC CTGTGATATC 120
ATGTCATTTG TTTTTTTGAT TATCAGGTTG CTGTACACCT AGTTATAATC ATATTTATAC 180
AATATAGTTA TAATGATATT TATACATGAT CAAACTAGTG TAACTTTCTC CGCTTTAGTG 240
ATGTCCAGCG GCAGAATAAC AGCTCGTTAA TTCCTGCTCG TGCAGATGAT GAGACGGACA 300
AAAGTAACCA ATGCATGCCA TTCTTTTACT TATTTTTGTG TTGTCAGATT CACAATGCAA 360
ACAGCTCCCG GTAGGAATAA CTCGAGTGAA CATAAAACAA AGCCGATTAA AACTTTCTTG 420
CTCTGCTCAG CTGCACAACA CACAGCGAGC TCACATAATC CAGCATGCGT GTCGAACTAC 480
ACTACCCACA ATACACTTCG CTATGGACTA CAAATCCCGT AAATATTCTA TTCCCTCTCT 540
CCTGCAACTC TACTGTGCAA AACTGATACT AAAATTGTTT TACATTTGGT TTTGTAGTTC 600
GGGCCTAAAT AAATGTTTGT TGCCGTTTTT AATCGTTTTA AGTTTATTTG AATGACTATA 660
TATAAACCAT TTGACATTAT TAACGTATTT ATTGGGTAAA ATTGCTACTT TTTACTGTCA 720
TTCATTGTGT TTTGGTCATT ATCAATGCAC TGTCACTTTA ATTGAGCGTG AGCAGCGCGT 780
CAAAAATAGA CCCAGCGCCG AAACTATCGC TGCACTGCTG CTTCGGCGAT GCTCACGCCT 840
CGCTCTGACG CGCTGCTGCT GCGTGCGGTA TGAAAGCTCT AATCTGTTAA CATGGACGCC 900
GAAAACACAC GCTCTGCTCA CGCGCCGCTG ACGCTTGCGG TGTGAAACAG GCGTTACACT 960
TGAAGACTTG AGCTGTGCAT CGATAGATTA CTATTCAGTG TTTGGACTCT CAGCATTGAA 1020
TATTAAACCA CACGGAACTA AACAAAACTG AACTTCAACT CTGAAAACTG AGCTGACACT 1080
GTTTCAATTC ACTACAATCT TCTATGTGAA GCTGCTTTGA CACAATCAAC ATTGTAAAAG 1140
CGCTATAGAA ATAAAGATGA ATTGAATTAC AGTAAGAAAT AATCACGTCA CAGAATGACG 1200
TGCTGAATAA AGCAGTTCAA TCAGGCAAGC TAAGCTTTAG CTGCAGCTAA AATTAAATGC 1260
TTGGGGAAAC AACTCCACAC AAAAAAATTA ATGCCATGAT CATGTTACAG ATAGGGATGC 1320
TCATTTCGGT TAATTTTGCT AACTGACAAC CGCCGCTCAT TAATCGGTTA TTAATGGTTA 1380
ACTGGTCAGA TTACTATTAA TTTAAATTAA ACAAATTGAC GTGTCTATTT TGTGTCTGAC 1440
ACATTAAATA TTGCCTTTTA AAATAGGCTA CTGATTTATT TTTACATGCT AGCATAATAA 1500
TAATAGAACA ATACAACAGA GCATTTTCAC GCACCTGCAG TGTTTAGCAC AGAAGATCAG 1560
AATAAACTAA ATAAAATGAA TAAAATAAAT AGGACTGCCC TAAATTATTT ACACTTAAAT 1620
AATTAATTTA TATTACAAAA CGAAAATACT GACTGATTCT TTTTAATAAC CGGCATAGGC 1680
TGCTTTTTTC CCACATCATA GCCTATGTTT TTTCTTCCGT CAAATAAAAA TCGCACTTTC 1740
TTAAATTGCT TGCTCCACGG AAAATATGCC TTTATTTAAT GCCCCGTTGT TATTAATATG 1800
AACCACAAAA CCTTTTACAT TTGTAATAGA AATCATTATT TTAAAGAATA TGTCCTGATA 1860
TATGGTTTCC TCTCTCTCCC TCGTGGTTCA AGTGCGCGCG CTGCGTGATG AAAAGACAGC 1920
AACAACGCGC 1930