EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40116 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:7287062-7288056 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:7287732-7287743ATGTTTACATA-6.14
FOXC1MA0032.2chr3:7287732-7287743ATGTTTACATA-6.32
FOXK2MA1103.1chr3:7287731-7287742CATGTTTACAT-6.14
HNF4GMA0484.1chr3:7287983-7287998TGAGAACAAAGTTCA+6.1
Enhancer Sequence
GTCCATCCCT GACCTAGGCT TTGACAAAAA TGTGTGGCGT AAGCCATAAA GCAGATGGCA 60
CTGTTCCAAC TCTTTGGTAT TTCTATATAT ATCCATTGTG TAGCAGGGGT CACTCACCGA 120
AAGTTGCAAG GGTGACAGGA GGCTGTTCTG GTGAAAGCAG CTGAATGTAT CTAGTTGAAA 180
GCCTTGAACG GCTCAGCTGT CCAGTATTTG AGGGAGCTCC TGGTGTATTA TTGCCCCTCA 240
CGTCCACTAC GCTCAATTAA TTCTACTAAG TGGAAAGCTA CTTTTGTCTC CTCCACTTTT 300
TGACTTAAAA AAAACGGTCT GATCCGTGAC TAAAAATCCA TAATGTGATC AGAACCGGAA 360
GCAAAATGAA TGGCAGTTTC AAGAGAATGT GAAGTAAGGA TGTTGGGCTA ATGACCCACC 420
TCATAAAAAC TAGATGTTCC GAAACACCAA CATGGTGAGG CTAAACATCA ACTTTGATAT 480
TGTAAGGCTT GAAGTTTACG CTGCTATTCT GAACCAATAA TCGGAAACAG AAAGCAGTTG 540
AAGGATGGCG TGTTTAAATC CATTATTTTT CTGACTCCTT TGTAATTAAT CTGACTCCAT 600
TACAGTTGTT ATCATCACTG ATAAAGAGAA AGAATCTCAA AGCTTAAGGC AAAGATGTTT 660
ATTAAGTTAC ATGTTTACAT ATACAGACAG TAGAATGACA CAAACTAACA TACTGTATAA 720
AGAAATTAGC TGTAACATAT GCACTGCTGA GCAATAAAGA CAGTGAAGCT GCCTTTGTTA 780
GCATATGAGG CTATGCACCT GTGTGCGGGA GAAGCAGAGT AAAAGCCATT CTCCCAGCTC 840
AACAGTTACC TTTCCCTATT ATACCCTGAG CAGAGCATTG TCAAACATGA GTGAAAACCA 900
ACCCCCAAAA CCAGCTTTAC ATGAGAACAA AGTTCAGGAG ATGAAGTGGG GGAGAAGTAC 960
ATTAACACAC TCTCCATGCT TGGAATGTCT CAGT 994