EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:7233950-7234987 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr3:7234040-7234052ATTGTTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr3:7234037-7234054CTGATTGTTTACATTTA-6.19
Nkx3-2MA0122.3chr3:7234073-7234086ATTAAGTGTTTTA-6.16
SNAI2MA0745.2chr3:7234663-7234673TGCACCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
ATAGGTGTTT CTCCCCTGTT CAATAAATGT GTGTGTAAGT CTTGAGTGGC CGATTCTACA 60
TGTCATGTGT GCAGCGTGAT CATGTCTCTG ATTGTTTACA TTTATCTCTC AATATTTTAA 120
TGAATTAAGT GTTTTATATT ATTATACTGA TCCCAAATTC TGTTTTACTG CAAAATAAAG 180
CGTTTGCGTC TCTTCAAGAG TTTACACAAG CATATGTTCA GTTAAACAGT CAATATTCAA 240
TATAATCAGC ATTAAACTAC CTCTTAGTGA ATGAATTAGA TGGAGACACA AATGAAAGGT 300
GTCCAGATAA CCCGTGAGTA AGACATTACA AGAGTGTTTA CAGCGTAGCA TCGAGCTAAA 360
AACAAGAGAG TATATTAGCA TTGAGCACAT ATGTTAAAGC GGTTCAAACC GCAAGATAAT 420
TCCCGCAAGT CTGCGAACGC TACTGTGGTC AGATATCATA CACTTACTCT GAACAGACGA 480
ACAACACCCG TAACAGAAGA GGAAATAAGC ACATTAAACG TCAAACAGCA AAGTTCTGCT 540
CTCTCCGATC TCCGCCTCAC AATAAGCGCT GTGGGCGGGA TGTTTGCCTG CGCGTTGATC 600
TGCGAAAGCT GATTGGCTGC CTGTAGCAGG TTCTGAGAAA GCTGAAAGTC TGTAGGTTCA 660
GAGGAATTGC GGGTGTTCAG TCAGGAGAAA TAGTAAGTGG TTTGTTTTGG TAGTGCACCT 720
GTTATGAAGT GTTTCGGGTT GACTTTATAT TTTCTTAAAA ATGTTTTAAC TGCGTTAAGC 780
GTTTTAGAAT GTAGTAACTT AATTTAGCTT AGCATTAGCT TAATTTTTAA CTTGCTTTCA 840
TGTGACCGAG TCAGGGCTAA TGTTATATTT CAGTCAGGAT AGCGTGAAAT TTGCATCTTA 900
ATCCCTTTAT CCTGGTTTTG TGAGATACAC TCAGAAAATA TGAACTGATA AAGAAAGTAA 960
GAAACATAAA TAAGGAGGGT AACATATACC CATGAGAAGA GTTTAGTTGA CACCGTGGTA 1020
ATGCCCACTA TCAATCT 1037