EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40109 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:7219960-7220348 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:7220301-7220314AAATTAATTAATC+7.82
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CCCAAATTCT GTTTTACTGC AAAATAAAGC GTTTGCGTCT CTTCAAGAGT TTACACAAGC 60
ATATGTTCAG TTAAACAGTC AATATTCAAT ATAATCAGCA TTAAACTACC TCTTAGTGAA 120
TGAATTAGAT GGAGACACAA ATGAAAGGTG TCCAGATAAC CCGTGAGTAA GACATTACAA 180
GAGTGTTTAC AGCGTAGCAT CGAGCTAAAA ACAAGAGAGT ATATTAGCAT TGAGCACACA 240
TGTTAAAGCG GTTCACACCG CAAGTCTGCG AACGCTACTA TGGTCAGATA TCATACACTT 300
ACTCTGAACA GACGAATAAC ACCTATAACA GAAGAGGAAT TAAATTAATT AATCCTCAAA 360
CAGCAAAATT CAGCTCTCTC TGATCTCC 388