EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-40033 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr3:5330936-5332360 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SOX15MA1152.1chr3:5331337-5331347CTATTGTTTT+6.02
SRFMA0083.3chr3:5331253-5331269TTCCCTTATATGGTCA+6.99
SRFMA0083.3chr3:5331253-5331269TTCCCTTATATGGTCA-7.99
Enhancer Sequence
TTCCTGATGT TTCAATGTTC CAAAACAAGT TTGTAATCCT CCCCTCATGT TTGAATTCTG 60
AAGTTCAAAC CAAAAGCTAA TAATATATTT CACACACACA CACACACACA CACACTCACA 120
CTCACACACA CACACACACA TTGATATCAT TAGCCTCAGA GGTGTGCAGC ATGCCAAGAC 180
CAACGCAAGC AAGCACTTTA CTACAGCCAA AGAAAGAGCC TGAGGGAAAA AACATCATTA 240
AACATGAGTA AGGGAAAAGT GACGGAGTGT GAAAGAAAAA GAGAGAGCGG AGGAATCTGC 300
AGCGGCGCTC TGTGTTTTTC CCTTATATGG TCAAACAGAG GGCGAGAGAG AGAGAGAGAG 360
AGAGAGAGAG AGAAAGAGAG AGAGAGAGGT GGAGGTGTGG TCTATTGTTT TTGCGGGAGG 420
AAGAGGTGTA GAGTTTCTCT TCCGTCATTC TTTCACCTTC TGCACTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTGTGTGTGT GTGTTTGTGT GTGTGTGTGT CTAAAACAAA GATATCAATC ACTTCTGGAC 540
ACAAACATTA GTCCAGCACT CATAGAGAAA AGCATCAGAT TAATCACAGA GCCGATGATT 600
AACTCTCTAA ACCTTTGGTT TCACACCACA TCAACAGCAT GAAAGCACAT GTTTTGCATA 660
TTCATGAATA TTTGCATAGG ATTATTACAT TTTGAGTGCG AGTTGCAGGG CTGATATTGT 720
CAAAAACAAA CAATGTTTTT TAATTGCAAT GTTATTTTAT CAGTCTGTGT GTGAATCAAC 780
AGTTAAAGCA GACGTTTTTT TTAGTATGAT GAAACTAAAT ATTGAGTAGA GGCGGGGTTT 840
TATTTCAGTA TGATGATATA TTTCCAACTG AAAAAAAATA TTGAGTAGGT AGCGGGGTTT 900
CATTTCAGTC TAATGACATA TTTCCAACTG AATATTAAGT AGGGGATGGG GATTTTATTT 960
CAGTATGTTG ACGCATTTCC AACTAAAAAT TAAATATTGA GTAGGGGGTG GGGTCTCATT 1020
TCAGTATGAA GAAATATTTC CAACTGAAAT GGAATATTGA GTAGGAGGCA GGGTCTCATT 1080
TCAGTATGAT GACATTTTTT CAACTGAAAT GGAATTTTGA GTAGGAGGCG GGGTTTATTT 1140
CAGAATAATG ATTGTATTTC TAACTGAAAC AGAATATTGA GTAGAGGGCG GGGTACAATT 1200
TCAGTATAAT GACGTATTTC CAACTGAATA TAGGGGACGG GGATTTATTT CAGTATGATA 1260
AAGAATTTCC AACTGAAACA GAATATTGAG TAGGGGGTGT GGTTTAATTT CAGTGTAATG 1320
ATGTATTTCC AACTGAAAGT GAATATTGAG TAGGGAGTGT GGTTTAATTT CAGTGTAATG 1380
ACATATTTCC AACTGAAATG GAATATTGAG TAGGGGGTGG GGTC 1424